RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ADCK1Q86TW2 530 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SLC9B2Q86UD5 537 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 FAM129CQ86XR2 697 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PLD3Q8IV08 490 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 OR4K1Q8NGD4 311 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 BBS10Q8TAM1 723 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 C16orf78Q8WTQ4 265 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SLC38A4Q969I6 547 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SLC22A18Q96BI1 424 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 C14orf79Q96F83 325 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 TPD52L3Q96J77 140 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PLEKHA8Q96JA3 519 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 FAM210AQ96ND0 272 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 FOXC2Q99958 501 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 COPS4Q9BT78 406 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SARGQ9BW04 601 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 OR2AG1Q9H205 316 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 WDR26Q9H7D7 661 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CLN6Q9NWW5 311 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 P2RX2Q9UBL9 471 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ABCG2Q9UNQ0 655 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 LIPT1Q9Y234 373 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.21e-8■■■■■ 37.5
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GGA3-218ENST00000584243 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 TRBC2A0A5B9 178 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 C19orf84I3L1E1 186 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SCAMP1O15126 338 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 GADD45GO95257 159 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SOD1P00441 154 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 IL7RP16871 459 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ACVR2AP27037 513 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CCKBRP32239 447 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 S100A5P33763 92 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CA5AP35218 305 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 XCR1P46094 333 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 BDKRB1P46663 353 aa7.56□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 HBA1P69905 142 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PRR5P85299 388 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PLIN5Q00G26 463 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SPIBQ01892 262 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ZNF45Q02386 682 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 TMED1Q13445 227 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CTF1Q16619 201 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 FGD3Q5JSP0 725 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SAXO2Q658L1 398 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 TMEM215Q68D42 235 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PNCKQ6P2M8 343 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 KLHL35Q6PF15 583 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 LACC1Q8IV20 430 aa7.56□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CDC26Q8NHZ8 85 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 FAR1Q8WVX9 515 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SORCS1Q8WY21 1168 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 NRGNQ92686 78 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 YIPF6Q96EC8 236 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 EGLN2Q96KS0 407 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 KCNC2Q96PR1 638 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 TEX101Q9BY14 249 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 MS4A8Q9BY19 250 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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