RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	DIO2	Q92813	273 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TP53INP1	Q96A56	240 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	REPS1	Q96D71	796 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CCDC126	Q96EE4	140 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	APIP	Q96GX9	242 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	FRG2B	Q96QU4	278 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	UCN2	Q96RP3	112 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TRIB1	Q96RU8	372 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	MDFI	Q99750	246 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TM9SF2	Q99805	663 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CENPK	Q9BS16	269 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	NTMT1	Q9BV86	223 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ACPT	Q9BZG2	426 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PIGM	Q9H3S5	423 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PHF11	Q9UIL8	331 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SNX6	Q9UNH7	406 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ZFHX3	Q15911	3703 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SH3D21	A4FU49	640 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GLOD5	A6NK44	160 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688		H3BQF6	201 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	AZIN1	O14977	448 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PIP5K1B	O14986	540 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TM9SF1	O15321	606 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TMPRSS11D	O60235	418 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	FGF17	O60258	216 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	UGDH	O60701	494 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	RCBTB2	O95199	551 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ESRRB	O95718	433 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	KLK1	P06870	262 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	LINC00032	P0C843	101 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	KIT	P10721	976 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CYP4B1	P13584	511 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CPN1	P15169	458 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	BMP7	P18075	431 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CHM	P24386	653 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CPA2	P48052	419 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	DIO3	P55073	304 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PKNOX1	P55347	436 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	NRG3	P56975	720 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SLC37A1	P57057	533 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PCDH1	Q08174	1060 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	BST1	Q10588	318 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SLAMF1	Q13291	335 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	E2F2	Q14209	437 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	IMPG1	Q17R60	797 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GALNTL6	Q49A17	601 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	KANK2	Q63ZY3	851 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	C18orf63	Q68DL7	685 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GPR180	Q86V85	440 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	OR2T11	Q8NH01	316 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	RIT1	Q92963	219 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	RILP	Q96NA2	401 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	UBQLN3	Q9H347	655 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PNPO	Q9NVS9	261 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		6.25	□□□□□ -1.41

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