RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 PRIM2P49643 509 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL14P50914 215 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC18A1P54219 525 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL38P63173 70 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 STX3Q13277 289 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PCLAFQ15004 111 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CEBPEQ15744 281 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 C3AR1Q16581 482 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 DPY19L1Q2PZI1 675 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SPDYE7PQ495Y7 208 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GXYLT1Q4G148 440 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CMPK2Q5EBM0 449 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PDSS1Q5T2R2 415 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CPTPQ5TA50 214 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ANXA8L1Q5VT79 327 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 KANK2Q63ZY3 851 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TIGD3Q6B0B8 471 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CLEC6AQ6EIG7 209 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM71E1Q6IPT2 247 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SPNS3Q6ZMD2 512 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TRILQ7L0X0 811 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SZRD1Q7Z422 152 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 DOLPP1Q86YN1 238 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 MMP21Q8N119 569 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2L13Q8N349 312 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM251Q8N6I4 163 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIML2Q8N7C3 387 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF615Q8N8J6 731 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF441Q8N8Z8 693 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CDRT4Q8N9R6 151 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10G3Q8NGC4 313 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 OR4K17Q8NGC6 315 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2W6PQ8NHA6 318 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 NEIL3Q8TAT5 605 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SPPL2AQ8TCT8 520 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TWIST2Q8WVJ9 160 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ADIPOR1Q96A54 375 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TUBGCP3Q96CW5 907 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 OMA1Q96E52 524 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CHMP6Q96FZ7 201 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFP3Q96NJ6 502 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB18Q99592 522 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 EBPLQ9BY08 206 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 HES7Q9BYE0 225 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXD1Q9GZZ0 328 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 DEFB127Q9H1M4 99 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 REEP4Q9H6H4 257 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PLSCR2Q9NRY7 297 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ALKBH4Q9NXW9 302 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 MAT2BQ9NZL9 334 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF639Q9UID6 485 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 DKKL1Q9UK85 242 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 EMCNQ9ULC0 261 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CBLCQ9ULV8 474 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa5.15□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GTF3C1Q12789 2109 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 RTTNQ86VV8 2226 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM247A6NEH6 219 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 WASHC1A8K0Z3 465 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 LSM1O15116 133 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CFLARO15519 480 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 EMC8O43402 210 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TYROBPO43914 113 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PEX11AO75192 247 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 AK1P00568 194 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ALOX5P09917 674 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP4B1P13584 511 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CAPN3P20807 821 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 S1PR1P21453 382 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ME2P23368 584 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SSTR2P30874 369 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PTGER1P34995 402 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PIGAP37287 484 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 RFC3P40938 356 aa5.14□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
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