RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	TTC36	A6NLP5	189 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	T	O15178	435 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	SNX4	O95219	450 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	KCNH1	O95259	989 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	C6orf47	O95873	294 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	LAMP1	P11279	417 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	GDF1	P27539	372 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	SOX18	P35713	384 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	NME5	P56597	212 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	PER3	P56645	1201 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	HSF1	Q00613	529 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	MLC1	Q15049	377 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	DECR1	Q16698	335 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	PACS2	Q86VP3	889 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	C7orf26	Q96N11	449 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	RILP	Q96NA2	401 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	ADO	Q96SZ5	270 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	CBLC	Q9ULV8	474 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CHID1-222	ENST00000533059		A0A1B0GUH1	482 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059		E9PBE3	544 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	SLC19A2	O60779	497 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	UGT2B11	O75310	529 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	PDE9A	O76083	593 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	CT45A8	P0DMV1	189 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	CT45A9	P0DMV2	189 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	MAGEA5	P43359	124 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	KIR3DL1	P43629	444 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	TP53BP2	Q13625	1128 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	OGFOD2	Q6N063	350 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	FJX1	Q86VR8	437 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	SIAH3	Q8IW03	269 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	FBXO30	Q8TB52	745 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	GPR151	Q8TDV0	419 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	MOAP1	Q96BY2	351 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	COQ8B	Q96D53	544 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	AIG1	Q9NVV5	245 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	TENM4	Q6N022	2769 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	PRRG2	O14669	202 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	GNB5	O14775	395 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	LRRTM2	O43300	516 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	PSMG1	O95456	288 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	TPO	P07202	933 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	KRT16	P08779	473 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	ALOX5	P09917	674 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	IDO1	P14902	403 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	S100A3	P33764	101 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	GABRA3	P34903	492 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	PTGS2	P35354	604 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	CASP3	P42574	277 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	PNLIPRP2	P54317	469 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	C21orf58	P58505	322 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	STX1B	P61266	288 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	PSG6	Q00889	435 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	SLC10A1	Q14973	349 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	C4orf17	Q53FE4	359 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	EID3	Q8N140	333 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	COX18	Q8N8Q8	333 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CHID1-222	ENST00000533059	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		12.69	□□□□□ -0.38

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