RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526040.6

RPS6KA1-212, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 500 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1-212ENST00000526040 KLRF1Q9NZS2 232 aa24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 C2orf72A6NCS6 295 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ESPNB1AK53 854 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 PLOD2O00469 737 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 TSPAN2O60636 221 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 COQ9O75208 318 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 GLI4P10075 376 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 GABRA1P14867 456 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 PTPN6P29350 595 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 CHRNB4P30926 498 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 KIR3DL1P43629 444 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 RPL38P63173 70 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 PSPHP78330 225 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 TOMM20Q15388 145 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 KRT71Q3SY84 523 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 C1orf185Q5T7R7 199 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 LILRB4Q8NHJ6 448 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 SLC35A4Q96G79 324 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ADOQ96SZ5 270 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCT7Q99832 543 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 GALNT9Q9HCQ5 603 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 RAB21Q9UL25 225 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 PRAMEF25A6NGN4 478 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 SNPHO15079 494 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 LSM1O15116 133 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ABCB7O75027 752 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 BPGMP07738 259 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 SDC1P18827 310 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 KRT20P35900 424 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF844Q08AG5 666 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 GALNTL6Q49A17 601 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 SH2D4BQ5SQS7 431 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 OR4N2Q8NGD1 307 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 AGR3Q8TD06 166 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ELP4Q96EB1 424 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 TSSK3Q96PN8 268 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 TMED5Q9Y3A6 229 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 UPK1AO00322 258 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 PIP5K1BO14986 540 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 IL12BP29460 328 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 PTGER4P35408 488 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 SERPINB5P36952 375 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ETV4P43268 484 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 PNLIPRP2P54317 469 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 PSG6Q00889 435 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 REEP4Q9H6H4 257 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 SLC6A5Q9Y345 797 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 OR10H1Q9Y4A9 318 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 HCFC1P51610 2035 aa24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 CTIFO43310 598 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 AKAP10O43572 662 aa24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARRB2P32121 409 aa24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 EFR3AQ14156 821 aa24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 EIPR1Q53HC9 387 aa24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 OR2L13Q8N349 312 aa24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 TIMP4Q99727 224 aa24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 UCK2Q9BZX2 261 aa24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 CELSR2Q9HCU4 2923 aa24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 FAM90A27PA6NNH2 459 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 TBX19O60806 448 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF385BQ569K4 471 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ULK2Q8IYT8 1036 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 WDSUB1Q8N9V3 476 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 OR6Y1Q8NGX8 325 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 CLHC1Q8NHS4 586 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 PPCDCQ96CD2 204 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ENKD1Q9H0I2 346 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 KCNJ16Q9NPI9 418 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 SH3BP4Q9P0V3 963 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 MAPRE3Q9UPY8 281 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 PKDREJQ9NTG1 2253 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KA1-212ENST00000526040 A0A0G2JNJ9 132 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KA1-212ENST00000526040 NKX2-6A6NCS4 301 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KA1-212ENST00000526040 AHRRA9YTQ3 701 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KA1-212ENST00000526040 PDPK1O15530 556 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KA1-212ENST00000526040 CBR3O75828 277 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KA1-212ENST00000526040 PSMG1O95456 288 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KA1-212ENST00000526040 IFI6P09912 130 aa24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms