RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	MCU	Q8NE86	351 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ACCS	Q96QU6	501 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CYTH2	Q99418	400 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT12	Q99456	494 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ASCL2	Q99929	193 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	LHX9	Q9NQ69	397 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636		A8MU76	341 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	C21orf140	B9A014	251 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636		E7ENX8	843 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636		E9PLN8	166 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636		K7EQM0	130 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	FPGT	O14772	594 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	HS3ST1	O14792	307 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ALOX15B	O15296	676 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	LIAS	O43766	372 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TBL1X	O60907	577 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	AVIL	O75366	819 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ATP5H	O75947	161 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PEX11B	O96011	259 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	IFNA2	P01563	188 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ROS1	P08922	2347 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ALPI	P09923	528 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ACP5	P13686	325 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF20	P17024	532 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TPH1	P17752	444 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	DRD5	P21918	477 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ACHE	P22303	614 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CXCR5	P32302	372 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	HTR7	P34969	479 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CAMP	P49913	170 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	MTTP	P55157	894 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ENPEP	Q07075	957 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	HERC1	Q15751	4861 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	UGP2	Q16851	508 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	GKN2	Q86XP6	184 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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