RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518885.1

CNOT7-204, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 7, human

TSL 3

Gene CNOT7, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT7-204	ENST00000518885	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		22.14	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		22.14	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	OR2T11	Q8NH01	316 aa		22.14	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	AGR3	Q8TD06	166 aa		22.14	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	HGD	Q93099	445 aa		22.14	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	22.14	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC35A4	Q96G79	324 aa		22.14	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		22.14	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		22.14	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		22.14	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		22.14	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	ZWINT	O95229	277 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	HSPA4L	O95757	839 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	HPN	P05981	417 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	CT45A8	P0DMV1	189 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	CT45A9	P0DMV2	189 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	SDC1	P18827	310 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	MC3R	P41968	323 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	ETV4	P43268	484 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	PNLIPRP2	P54317	469 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	OR2L13	Q8N349	312 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	MARVELD3	Q96A59	401 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885		Q9N2J8	555 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		22.13	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	UGT2B11	O75310	529 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	COX6B1	P14854	86 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	TACR1	P25103	407 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	SERPINB4	P48594	390 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	EMC4	Q5J8M3	183 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	ELP4	Q96EB1	424 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	PGM2	Q96G03	612 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	EGLN2	Q96KS0	407 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	TSSK3	Q96PN8	268 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	ADO	Q96SZ5	270 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	GTF3C1	Q12789	2109 aa		22.12	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	TMEM233	B4DJY2	109 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	ICOSLG	O75144	302 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	CBR3	O75828	277 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	SERPINE1	P05121	402 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	CREB1	P16220	341 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	GRK2	P25098	689 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	CORO7	P57737	925 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	PMPCA	Q10713	525 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	DECR1	Q16698	335 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	NATD1	Q8N6N6	113 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	GNRHR2	Q96P88	292 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	ZIM3	Q96PE6	472 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	NODAL	Q96S42	347 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	UBQLN3	Q9H347	655 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	22.11	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	UPK1A	O00322	258 aa		22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	GNB5	O14775	395 aa		22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	SNPH	O15079	494 aa		22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	AKAP10	O43572	662 aa		22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	PRPS2	P11908	318 aa		22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	BCKDHA	P12694	445 aa		22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	TRPC1	P48995	793 aa		22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	HSPB3	Q12988	150 aa		22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	XKR7	Q5GH72	579 aa		22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		22.1	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		22.09	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	TSPAN2	O60636	221 aa		22.09	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	PEX11A	O75192	247 aa		22.09	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	PTPN6	P29350	595 aa		22.09	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	PDE7A	Q13946	482 aa		22.09	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	22.09	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		22.09	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		22.09	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		22.09	■■□□□ 1.13
CNOT7-204	ENST00000518885	HHATL	Q9HCP6	504 aa		22.09	■■□□□ 1.13

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