RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2M2Q96R28 347 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 COQ7Q99807 217 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 TEKT3Q9BXF9 490 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 C5orf66Q9H5L9 145 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 COG4Q9H9E3 785 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 RETNQ9HD89 108 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 SH2D2AQ9NP31 389 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 WASH6PQ9NQA3 447 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 NANSQ9NR45 359 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 NRBP1Q9UHY1 535 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 IFT52Q9Y366 437 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-287P-201ENST00000516230 NBEAQ8NFP9 2946 aa-0.22□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa-0.22□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAT1Q14517 4588 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 MUC3AQ02505 3323 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 TNXBP22105 4242 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPEGQ15772 3267 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A1B0GWB2 263 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A1W2PPM1 405 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 CTDSP2O14595 271 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANGPTL7O43827 346 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 EFNA2O43921 213 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 KIAA0513O60268 411 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 TBX10O75333 385 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDRT1O95170 752 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGLV2-8P01709 118 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANGP03950 147 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 GBAP04062 536 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 LAMP2P13473 410 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 GLULP15104 373 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ERCC2P18074 760 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ACKR3P25106 362 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 UCP1P25874 307 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAPK4P31152 587 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 HPDP32754 393 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARL3P36405 182 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 TNFSF9P41273 254 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 METAP1P53582 386 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 IL15RAQ13261 267 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAMLD1Q13495 774 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPR50Q13585 617 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 IRF3Q14653 427 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 PTPRCAPQ14761 206 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 NSDHLQ15738 373 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 STK11Q15831 433 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 SEL1L2Q5TEA6 688 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 FBXW9Q5XUX1 488 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 CXCL17Q6UXB2 119 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPNS3Q6ZMD2 512 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 C19orf35Q6ZS72 473 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRSS41Q7RTY9 318 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 KBTBD6Q86V97 674 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 HEATR4Q86WZ0 1026 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM25Q86YD3 366 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ESX1Q8N693 406 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 KIAA0895Q8NCT3 520 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR9A1PQ8NGU1 263 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR1P1Q8NH06 330 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 RFESDQ8TAC1 157 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 RFFLQ8WZ73 363 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 USP6NLQ92738 828 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 P2RX5Q93086 422 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 MCHR2Q969V1 340 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 PNPLA2Q96AD5 504 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM159Q96B96 161 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 BIRC7Q96CA5 298 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 HAVCR1Q96D42 359 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 VPS39Q96JC1 886 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ERGIC2Q96RQ1 377 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 Q9HAA7 133 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 DNAJC11Q9NVH1 559 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 GDE1Q9NZC3 331 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDH9Q9ULB4 789 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms