RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM246Q9BRR3 403 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A0B4J293 547 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM170BA6NMN3 283 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CASKO14936 926 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 NTN1O95631 604 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ALPPP05187 535 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 EPCAMP16422 314 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 IFNGR2P38484 337 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 VIPR2P41587 438 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 HOXC5Q00444 222 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 TSPAN31Q12999 210 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF234Q14588 700 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF311Q5JNZ3 666 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM48Q8IWZ4 208 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM20CQ8IXL6 584 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 RSPRY1Q96DX4 576 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF31Q96EP0 1072 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 FERD3LQ96RJ6 166 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 XKR8Q9H6D3 395 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ATG4BQ9Y4P1 393 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CDH23Q9H251 3354 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 LALBAP00709 142 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 C8orf89P0DMQ9 161 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2A1Q8NGT9 310 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 OR8K5Q8NH50 307 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CAMK1GQ96NX5 476 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 PLSCR3Q9NRY6 295 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PR48 441 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 RFXAPO00287 272 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 SOX18P35713 384 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 DUSP2Q05923 314 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 C1orf53Q5VUE5 145 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM107Q6UX40 140 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 UBASH3BQ8TF42 649 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 KLK6Q92876 244 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 BEX2Q9BXY8 128 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 DEC1Q9P2X7 70 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 IGLON5A6NGN9 336 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CH25HO95992 272 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC1A3P43003 542 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 RRM2BQ7LG56 351 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ENKURQ8TC29 256 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF170Q96K19 258 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 GDF15Q99988 308 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 SEMA4GQ9NTN9 838 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PS29 197 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 SCO2O43819 266 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP3R1P63098 170 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM35AQ53FP2 167 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 NOXA1Q86UR1 476 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 OR4F15Q8NGB8 312 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 HDHD5Q9BXW7 423 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ASB4Q9Y574 426 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 C4orf51C9J302 202 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ERI3O43414 337 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CDH11P55287 796 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CHRNEQ04844 493 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAM2Q15035 370 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 WSCD2Q2TBF2 565 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 LCN1P1Q5VSP4 162 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 VRK2Q86Y07 508 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 Q8N402 240 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ACOT4Q8N9L9 421 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CLCA2Q9UQC9 943 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKRD34BA5PLL1 514 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CENPBD1B2RD01 187 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 BCL6P41182 706 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 OMPP47874 163 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC30A6Q6NXT4 461 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CNIH2Q6PI25 160 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 POGLUT1Q8NBL1 392 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 TTLQ8NG68 377 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 SFXN5Q8TD22 340 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 C12orf66Q96MD2 445 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 TMED9Q9BVK6 235 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC38A1Q9H2H9 487 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 TBC1D17Q9HA65 648 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC13A4Q9UKG4 626 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ANTXRLA6NF34 631 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 HPGDSO60760 199 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 TIMP1P01033 207 aa25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms