RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 CGAP01215 116 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 IDUAP35475 653 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 DR1Q01658 176 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF611Q8N823 705 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 OR4K17Q8NGC6 315 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 ADOQ96SZ5 270 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 RBBP8Q99708 897 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 IPPKQ9H8X2 491 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 A0A087X1B8 175 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 HS3ST1O14792 307 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 KLF4O43474 513 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 SEMA3DO95025 777 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 ATP1B1P05026 303 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 GFAPP14136 432 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 GRK2P25098 689 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 SSTR1P30872 391 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 GP5P40197 560 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 PIK3CGP48736 1102 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 MAPK12P53778 367 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 MGAT2Q10469 447 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 EFR3AQ14156 821 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 ETFDHQ16134 617 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 PFKFB4Q16877 469 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 MILR1Q7Z6M3 343 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 ATP6V1E2Q96A05 226 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 RNF122Q9H9V4 155 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 FANCFQ9NPI8 374 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 MAT2BQ9NZL9 334 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 RNF11Q9Y3C5 154 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 C1orf226A1L170 272 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 E7ESA3 106 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 TO15178 435 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 SEC14L5O43304 696 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 SOX30O94993 753 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 PLAUP00749 431 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 IL12BP29460 328 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 OCRLQ01968 901 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 DLG1Q12959 904 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 GTF2H2Q13888 395 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 PON3Q15166 354 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 SGCBQ16585 318 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 RAET1LQ5VY80 246 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF639Q9UID6 485 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 ADAM29Q9UKF5 820 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 SNX12Q9UMY4 172 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF175Q9Y473 711 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-215ENST00000510074 H0YC42 278 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 LINC01387J3KSC0 135 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 CLDN9O95484 217 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 THBDP07204 575 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 HK1P19367 917 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 CRABP2P29373 138 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 EMDP50402 254 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 GPX6P59796 221 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 GRTP1Q5TC63 336 aa14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms