RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 SERPINB1P30740 379 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 FMO3P31513 532 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPL3P39023 403 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 BMXP51813 675 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAZP56270 477 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 CSNK2BP67870 215 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC35A2P78381 396 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 VLDLRP98155 873 aa5.25□□□□□ -1.57
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ARHGEF3-215ENST00000498517 NR1D2Q14995 579 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 NPTX1Q15818 432 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 DGUOKQ16854 277 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.25□□□□□ -1.57
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CATSPEREQ5SY80 951 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 CPTPQ5TA50 214 aa5.25□□□□□ -1.57
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ARHGEF3-215ENST00000498517 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 KDM4DQ6B0I6 523 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAHD1Q6P587 224 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 FIGLAQ6QHK4 219 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 P2RY8Q86VZ1 359 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 GATAD2AQ86YP4 633 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 LURAP1LQ8IV03 231 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF175Q8N4F7 328 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC15A4Q8N697 577 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.25□□□□□ -1.57
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ABHD11Q8NFV4 315 aa5.25□□□□□ -1.57
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ARHGEF3-215ENST00000498517 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR4C6Q8NH72 309 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 CNIH3Q8TBE1 160 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 SAP25Q8TEE9 199 aa5.25□□□□□ -1.57
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ARHGEF3-215ENST00000498517 S100ZQ8WXG8 99 aa5.25□□□□□ -1.57
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ARHGEF3-215ENST00000498517 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF347Q96SE7 839 aa5.25□□□□□ -1.57
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ARHGEF3-215ENST00000498517 EPYCQ99645 322 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 PITX2Q99697 317 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
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ARHGEF3-215ENST00000498517 NLNQ9BYT8 704 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 ABCG4Q9H172 646 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHST8Q9H2A9 424 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 NT5DC2Q9H857 520 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 TPT1P8Q9HAU6 139 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 CAPN10Q9HC96 672 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 HMG20AQ9NP66 347 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM86C1Q9NVL1 165 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACTR10Q9NZ32 417 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP6V1HQ9UI12 483 aa5.25□□□□□ -1.57
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ARHGEF3-215ENST00000498517 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A0J9YY10 115 aa5.24□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa5.24□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PPV9 198 aa5.24□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRBC2A0A5B9 178 aa5.24□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 FEZF1A0PJY2 475 aa5.24□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 C1orf226A1L170 272 aa5.24□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR5K3A6NET4 321 aa5.24□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 URADA6NGE7 173 aa5.24□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 LILRA5A6NI73 299 aa5.24□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 GABRR3A8MPY1 467 aa5.24□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 J3QRK9 145 aa5.24□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 M0R3G1 203 aa5.24□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 BTN3A3O00478 584 aa5.24□□□□□ -1.57
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
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