RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	PARP6	Q2NL67	630 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	VPS36	Q86VN1	386 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC34A3	Q8N130	599 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	PHYHIP	Q92561	330 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	NYAP2	Q9P242	653 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	GRIN2D	O15399	1336 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC17A2	O00624	439 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC2A10	O95528	541 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CXCL14	O95715	111 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	PROS1	P07225	676 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SDC1	P18827	310 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	IDS	P22304	550 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ACVR1B	P36896	505 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	PUDP	Q08623	228 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CBX3	Q13185	183 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	IL23R	Q5VWK5	629 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM122A	Q96E09	287 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	OR4F4	Q96R69	305 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	COQ7	Q99807	217 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CARD6	Q9BX69	1037 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	STARD5	Q9NSY2	213 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	FZR1	Q9UM11	496 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	TNR	Q92752	1358 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	EPOP	A6NHQ4	379 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	STK17B	O94768	372 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	OLFM2	O95897	454 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615		P0C879	139 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF19	P17023	458 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	RPA1	P27694	616 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	OR1D4	P47884	311 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC6A8	P48029	635 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	MYBPC1	Q00872	1141 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SRY	Q05066	204 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CAMK4	Q16566	473 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	OR2L5	Q8NG80	312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	APPL1	Q9UKG1	709 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	MOK	Q9UQ07	419 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	VEGFD	O43915	354 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SDC3	O75056	442 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SERF1A	O75920	110 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	BAG2	O95816	211 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC26A2	P50443	739 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	RAB35	Q15286	201 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	HFE	Q30201	348 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	TADA1	Q96BN2	335 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	VPS39	Q96JC1	886 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	IL17C	Q9P0M4	197 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	PDE10A	Q9Y233	779 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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