RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 CXCR3P49682 368 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MBTPS1Q14703 1052 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PEA15Q15121 130 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TKFCQ3LXA3 575 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLK5Q496M5 336 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 THEM4Q5T1C6 240 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ORAI1Q96D31 301 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TPD52L3Q96J77 140 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TGM7Q96PF1 710 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIGQQ9BRB3 760 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FZD10Q9ULW2 581 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCTD3Q9Y597 815 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A087X0M5 115 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A1B0GX30 115 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GFYI3L273 518 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCL22O00626 93 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DVL2O14641 736 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 WNT1P04628 370 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF35P13682 527 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDHA2P29803 388 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ETV5P41161 510 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRYBA2P53672 197 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 BLOC1S1P78537 153 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ITPK1Q13572 414 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GINS1Q14691 196 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ALG11Q2TAA5 492 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDNFQ49AH0 187 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 LIPNQ5VXI9 398 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR52W1Q6IF63 320 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NPWQ8N729 165 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR6X1Q8NH79 312 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 METTL9Q9H1A3 318 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRO1933Q9H354 126 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SERHLQ9NQF3 203 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NANSQ9NR45 359 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCNTO95613 3336 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM72CH0Y354 149 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNFRSF11BO00300 401 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC7A4O43246 635 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNFRSF1BP20333 461 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MPGP29372 298 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 KDELR2P33947 212 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TGIF1Q15583 401 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRAM1Q15629 374 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RBBP7Q16576 425 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SSX6Q7RTT6 188 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TAC4Q86UU9 113 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM72BQ86X60 149 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms