RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 C17orf105B2RV13 164 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 CDC7O00311 574 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 SYT5O00445 386 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 CYR61O00622 381 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 HCN1O60741 890 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 CTNSO60931 367 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 PDE5AO76074 875 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 RAF1P04049 648 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 GABRA1P14867 456 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 ATP4BP51164 291 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 LIM2P55344 173 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 STX4Q12846 297 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 STX5Q13190 355 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 OPN5Q6U736 354 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 SEM1Q6ZVN7 128 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 CHSY3Q70JA7 882 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 CAMKMTQ7Z624 323 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF781Q8N8C0 355 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC2A12Q8TD20 617 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 EGFL8Q99944 293 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC6A15Q9H2J7 730 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 VWA7Q9Y334 891 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 CEPT1Q9Y6K0 416 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 ROS1P08922 2347 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 SONP18583 2426 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIM64BA6NI03 449 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 HSPB2A8KAH6 182 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 DVL2O14641 736 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 LDB3O75112 727 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 WDR47O94967 919 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 H6PDO95479 791 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 RFPL3SP0C7P2 107 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 TACR1P25103 407 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 GDF5P43026 501 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 ASCL1P50553 236 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 WNT3P56703 355 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 ID2Q02363 134 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 KEAP1Q14145 624 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 HSPB2Q16082 182 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 DEFB113Q30KQ7 82 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 PRAMEF20Q5VT98 475 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIM40Q6P9F5 258 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 CARM1Q86X55 608 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 CNTN4Q8IWV2 1026 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 METTL25Q8N6Q8 603 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 NAXEQ8NCW5 288 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 TTLQ8NG68 377 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 OR2L5Q8NG80 312 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 OR5L2Q8NGL0 311 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 OR8K3Q8NH51 312 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC126Q96EE4 140 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 LRRC46Q96FV0 321 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 SERINC2Q96SA4 455 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 ANKRD60Q9BZ19 345 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 WDR41Q9HAD4 459 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 DAPP1Q9UN19 280 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A096LPK6 155 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 E9PBE3 544 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 ATE1O95260 518 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 ETHE1O95571 254 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 C2P06681 752 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 IDO1P14902 403 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC7A1P30825 629 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 TRPC1P48995 793 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 NUDT2P50583 147 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC22A10Q63ZE4 541 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 ADNP2Q6IQ32 1131 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM45BPQ6NSW5 357 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 VN1R5Q7Z5H4 357 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 SNX32Q86XE0 403 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 KRT78Q8N1N4 520 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 TNIP2Q8NFZ5 429 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 CEP70Q8NHQ1 597 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM45AQ8TCE6 357 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-207ENST00000484547 C18orf12Q96KH6 178 aa10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms