RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 LYSMD1Q96S90 227 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 GHITMQ9H3K2 345 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 SERHL2Q9H4I8 314 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 TAS2R7Q9NYW3 318 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 PTTG3PQ9NZH4 202 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 ANXA3P12429 323 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 NPPBP16860 134 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP6V1E1P36543 226 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 TM4SF4P48230 202 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 CCR6P51684 374 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 CDH11P55287 796 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 COX10Q12887 443 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 WASH2PQ6VEQ5 465 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 Q6ZVU0 165 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 PRSS42Q7Z5A4 293 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 GPAT4Q86UL3 456 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 DBF4BQ8NFT6 615 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 KLK6Q92876 244 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 TRPC4Q9UBN4 977 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 MYO10Q9HD67 2058 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 HLA-DPB1P04440 258 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 CD3GP09693 182 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 XPAP23025 273 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 MAPK8P45983 427 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 GALEQ14376 348 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 DUSP6Q16828 381 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF485Q8NCK3 441 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 TEX47Q8TBZ9 253 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 ZFPM2Q8WW38 1151 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 SOCS4Q8WXH5 440 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 RIT1Q92963 219 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 IL17FQ96PD4 163 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 OR51J1Q9H342 316 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 TDP1Q9NUW8 608 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 PTGFRNQ9P2B2 879 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 CACNG2Q9Y698 323 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF215Q9Y6U7 377 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A0G2JN53 185 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM183AA6NL82 134 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC2A10O95528 541 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 DHFRP00374 187 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 RRASP10301 218 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 GJA1P17302 382 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 IL32P24001 234 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 GIFP27352 417 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 FLT3LGP49771 235 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 CNTN1Q12860 1018 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 BAMBIQ13145 260 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 LYPD4Q6UWN0 246 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 LUZP2Q86TE4 346 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 ADGRG3Q86Y34 549 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC43A3Q8NBI5 491 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 ECHDC3Q96DC8 303 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 NEURL3Q96EH8 262 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 ABHD1Q96SE0 405 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 A4GALTQ9NPC4 353 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 PLAGL1Q9UM63 463 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 DYRK1BQ9Y463 629 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 TEX46H3BTG2 121 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 GREM1O60565 184 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 ALPPL2P10696 532 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 PRKCZQ05513 592 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 IRF5Q13568 498 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 MINDY4Q4G0A6 757 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 EOGTQ5NDL2 527 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC27A4Q6P1M0 643 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 RASGRP3Q8IV61 690 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 MORN4Q8NDC4 146 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 RBP7Q96R05 134 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 ADAM30Q9UKF2 790 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-206ENST00000469947 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms