RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 SSR4P51571 173 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PSMD7P51665 324 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 DGKQP52824 942 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PHC1P78364 1004 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ARG2P78540 354 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PRR5P85299 388 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 DUSP8Q13202 625 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM64Q6YI46 380 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TAGAPQ8N103 731 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 C10orf82Q8WW14 230 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ADIPOR1Q96A54 375 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 MOAP1Q96BY2 351 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 MAGED4Q96JG8 741 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF385DQ9H6B1 395 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRA2Q9H9E1 313 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SAR1AQ9NR31 198 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PTPN13Q12923 2485 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 C9JVG2 144 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 DRD5P21918 477 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PPICP45877 212 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNK10P57789 538 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 HBA1P69905 142 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 OPN5Q6U736 354 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 CLECL1Q8IZS7 167 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM156Q8N614 296 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SMYD1Q8NB12 490 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SIMC1Q8NDZ2 872 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4A15Q8NGL6 344 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 OR9I1Q8NGQ6 314 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SFXN5Q8TD22 340 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC115Q96NT0 180 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 RASL10BQ96S79 203 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 RMND5AQ9H871 391 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 FOLH1BQ9HBA9 442 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PLA2G3Q9NZ20 509 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SNX8Q9Y5X2 465 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 OR5H15A6NDH6 313 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PSMG1O95456 288 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 CD96P40200 585 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 CYB561P49447 251 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 HLCSP50747 726 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 MLLT10P55197 1068 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 NRG3P56975 720 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PSPHP78330 225 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TUBA3CQ13748 450 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SPDYE7PQ495Y7 208 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 AGKQ53H12 422 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TUBA3EQ6PEY2 450 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 BHLHB9Q6PI77 547 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD46Q86W74 232 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 HORMAD2Q8N7B1 307 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 NUP43Q8NFH3 380 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 OR56A1Q8NGH5 318 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ASB15Q8WXK1 588 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 HSPBAP1Q96EW2 488 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ITPAQ9BY32 194 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 CXorf36Q9H7Y0 433 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 FRG2CA6NGY1 282 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 CAPN14A8MX76 684 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ACOX3O15254 700 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PRKAG1P54619 331 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 RCAN2Q14206 197 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SZRD1Q7Z422 152 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 FUNDC1Q8IVP5 155 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms