RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NUBPLQ8TB37 319 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 XAGE5Q8WWM1 108 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GATA6Q92908 595 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GIMAP5Q96F15 307 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VSTM2LQ96N03 204 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BTBD9Q96Q07 612 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR7D2Q96RA2 312 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ITPAQ9BY32 194 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIM15Q9C019 465 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIM4Q9C037 500 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PIGUQ9H490 435 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EPS8L2Q9H6S3 715 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM181Q9P2C4 612 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LIPT1Q9Y234 373 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPTBN2O15020 2390 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ELOVL7A1L3X0 281 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NME4O00746 187 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC28A2O43868 658 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HS6ST1O60243 411 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BCHEP06276 602 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR12D1P0DN82 309 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DRD5P21918 477 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ME2P23368 584 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPICP45877 212 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPR143P51810 404 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CRISP3P54108 245 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SELPLGQ14242 412 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NNATQ16517 81 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPAT3Q53EU6 434 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COX20Q5RI15 118 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRT73Q86Y46 540 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPACA3Q8IXA5 215 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIF2BQ8N4N8 673 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 METTL25Q8N6Q8 603 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC16A11Q8NCK7 471 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR5D16Q8NGK9 328 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ELP5Q8TE02 316 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDS1Q92903 461 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TP53INP1Q96A56 240 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HSPBAP1Q96EW2 488 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C16orf58Q96GQ5 468 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IMMP1LQ96LU5 166 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MESP1Q9BRJ9 268 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 G6PC3Q9BUM1 346 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BTBD2Q9BX70 525 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIM8Q9BZR9 551 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MUC13Q9H3R2 512 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PIF1Q9H611 641 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM38AQ9H6F2 299 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A4GALTQ9NPC4 353 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CMTM6Q9NX76 183 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CBLCQ9ULV8 474 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ERVK-11Q9UQG0 969 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.51□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CFAP73A6NFT4 308 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARGFXA6NJG6 315 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A8MUI8 341 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A8MVJ9 347 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HMGN4O00479 90 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GSC2O15499 205 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NKX2-8O15522 239 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EFSO43281 561 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PDE5AO76074 875 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PDE9AO76083 593 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NKX2-2O95096 273 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IFNA14P01570 189 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CLPSP04118 112 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARAFP10398 606 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACP2P11117 423 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BMP2P12643 396 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HSD17B1P14061 328 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCGF2P35227 344 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CASRP41180 1078 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RFX3P48380 749 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GSK3BP49841 420 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMPRSS3P57727 454 aa9.5□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CORO7P57737 925 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms