RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 PARP6Q2NL67 630 aa3.16□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.16□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 UNC5CLQ8IV45 518 aa3.16□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 FNDC8Q8TC99 324 aa3.16□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 TMEM186Q96B77 213 aa3.16□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 SPXQ9BT56 116 aa3.16□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 FAM114A2Q9NRY5 505 aa3.16□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 SPASTQ9UBP0 616 aa3.16□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 IL20RAQ9UHF4 553 aa3.16□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 BCAP29Q9UHQ4 241 aa3.16□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 NTNG1Q9Y2I2 539 aa3.16□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 A8MX80 341 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 NPIPA2E9PIF3 369 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 G3V3Y1 287 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 MT-ATP6P00846 226 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ETS1P14921 441 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 GDF1P27539 372 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 MDH2P40926 338 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ZSWIM7Q19AV6 140 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 GSG1Q2KHT4 349 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 LRIT3Q3SXY7 679 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PNCKQ6P2M8 343 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 NEK5Q6P3R8 708 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 P4HA3Q7Z4N8 544 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SLITRK2Q9H156 845 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 MBD2Q9UBB5 411 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 Q9UF83 564 aa3.15□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 IMPA2O14732 288 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 GPAA1O43292 621 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 TOXO94900 526 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 RALAP11233 206 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 IL2RGP31785 369 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 METAP1P53582 386 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SLC26A5P58743 744 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 STARD6P59095 220 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 HERVK_113P63132 956 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ERVK-8P63133 956 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SNX1Q13596 522 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 GAMTQ14353 236 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 RAB35Q15286 201 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 UTF1Q5T230 341 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 TATDN1Q6P1N9 297 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 OLFM4Q6UX06 510 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ERICH1Q86X53 443 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ELMOD2Q8IZ81 293 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 OR5M11Q96RB7 305 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 CARD6Q9BX69 1037 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ERVK-6Q9BXR3 956 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 DEFB126Q9BYW3 111 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 TMEM231Q9H6L2 316 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 GDAP2Q9NXN4 497 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 DHRS7Q9Y394 339 aa3.14□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SLC35G4P0C7Q5 338 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 CT45A10P0DMU9 189 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 TSPAN8P19075 237 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 IGFBP5P24593 272 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 RABIFP47224 123 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 OR1D4P47884 311 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ALDH3B2P48448 385 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 STK19P49842 368 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SERTAD2Q14140 314 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 KARSQ15046 597 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 TGIF1Q15583 401 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 QRICH1Q2TAL8 776 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 LDLRAP1Q5SW96 308 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 FCGR1BQ92637 280 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 CASD1Q96PB1 797 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ATG10Q9H0Y0 220 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 IKZF5Q9H5V7 419 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 GHRLQ9UBU3 117 aa3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 B4GALT7Q9UBV7 327 aa3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms