RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00471Q8N535 108 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF615Q8N8J6 731 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 COX18Q8N8Q8 333 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SLC16A11Q8NCK7 471 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OR52R1Q8NGF1 315 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OR2T29Q8NH02 315 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OR8K3Q8NH51 312 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OR5K1Q8NHB7 308 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FAM110BQ8TC76 370 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 GPR151Q8TDV0 419 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJC9Q8WXX5 260 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SLC9A6Q92581 669 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TP53INP1Q96A56 240 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TPD52L3Q96J77 140 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 C7orf34Q96L11 122 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RDH12Q96NR8 316 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 COPS7AQ9UBW8 275 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SLC13A4Q9UKG4 626 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 WDR45Q9Y484 360 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PS29 197 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 G3V2T6 193 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ACOX3O15254 700 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ALOX12BO75342 701 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DKK1O94907 266 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 H6PDO95479 791 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 LGI1O95970 557 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 C1QCP02747 245 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 IFNW1P05000 195 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FESP07332 822 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CT62P0C5K7 136 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 JMJD7P0C870 316 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ATP6V1C1P21283 382 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 MAOAP21397 527 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ERFP50548 548 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CASP9P55211 416 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ID2Q02363 134 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 NKG7Q16617 165 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RFX4Q33E94 735 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 EIPR1Q53HC9 387 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF311Q5JNZ3 666 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf189Q5VU69 101 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM205Q6UW68 189 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 COX15Q7KZN9 410 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TMPRSS12Q86WS5 348 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CMIPQ8IY22 773 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 KBTBD2Q8IY47 623 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF619Q8N2I2 560 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SLC38A9Q8NBW4 561 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OR5L2Q8NGL0 311 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 NRG4Q8WWG1 115 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TAMM41Q96BW9 452 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 HSPBAP1Q96EW2 488 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 VSTM2LQ96N03 204 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 COL21A1Q96P44 957 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 EPYCQ99645 322 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 VN1R1Q9GZP7 353 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RUBCNLQ9H714 662 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FOLH1BQ9HBA9 442 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 EQTNQ9NQ60 294 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SLC22A11Q9NSA0 550 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RAB26Q9ULW5 256 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 LOXL2Q9Y4K0 774 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DSPPQ9NZW4 1301 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 AGAP5A6NIR3 686 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 IDSB3KWA1 339 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PLD2O14939 933 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TO15178 435 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CSO75390 466 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 JRKO75564 520 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJB5O75953 348 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.8 ms