RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 LIPT1Q9Y234 373 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF337Q9Y3M9 751 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 OR6C70A6NIJ9 312 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 TO15178 435 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 CBX7O95931 251 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 DRD5P21918 477 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 GRK2P25098 689 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 PPICP45877 212 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 ADAM5Q6NVV9 412 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 TEX9Q8N6V9 391 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 OR52R1Q8NGF1 315 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 OR5M1Q8NGP8 315 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 NEUROG1Q92886 237 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC39Q96DD0 335 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 PBKQ96KB5 322 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 ADOQ96SZ5 270 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 ALG9Q9H6U8 611 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF175Q9Y473 711 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 UBXN8O00124 270 aa17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 AQP8O94778 261 aa17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 THBS1P07996 1170 aa17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 GAS1P54826 345 aa17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 CLDN20P56880 219 aa17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 DUSP2Q05923 314 aa17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 LIPJQ5W064 366 aa17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 ALKBH2Q6NS38 261 aa17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 DTNBP1Q96EV8 351 aa17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35A4Q96G79 324 aa17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 UBXN10Q96LJ8 280 aa17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 ACTR6Q9GZN1 396 aa17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 NUDT4Q9NZJ9 180 aa17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC4AQ9UMR7 237 aa17.29■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 SUPT3HB4E1H0 165 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 H0YIV9 168 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 TSPAN2O60636 221 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 SUPT3HO75486 399 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 HK1P19367 917 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 FEN1P39748 380 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 EMDP50402 254 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 GPX6P59796 221 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 PHEXP78562 749 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 RAET1LQ5VY80 246 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 ISCA2Q86U28 154 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO36Q8NEA4 188 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 OR4K17Q8NGC6 315 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 STAG3L4Q8TBR4 150 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 WDR20Q8TBZ3 569 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 UBTD2Q8WUN7 234 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 RNF138Q8WVD3 245 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 FBXW5Q969U6 566 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 TSPAN17Q96FV3 270 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 ATOH8Q96SQ7 321 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 DSN1Q9H410 356 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 CES1P1Q9UKY3 287 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 PCNX3Q9H6A9 2034 aa17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 H3BML4 177 aa17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 CLOCKO15516 846 aa17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 NME6O75414 186 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 STMN1P16949 149 aa17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 PIK3CGP48736 1102 aa17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 FAPQ12884 760 aa17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 DLG1Q12959 904 aa17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 LTB4RQ15722 352 aa17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 OR6K3Q8NGY3 331 aa17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 KCNK17Q96T54 332 aa17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 BEX2Q9BXY8 128 aa17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 RNF115Q9Y4L5 304 aa17.27■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa17.26■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 A0A096LNT2 108 aa17.26■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 OR2M5A3KFT3 312 aa17.26■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 ATP1B1P05026 303 aa17.26■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 KLK1P06870 262 aa17.26■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 SLC6A8P48029 635 aa17.26■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF844Q08AG5 666 aa17.26■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 MORF4L2Q15014 288 aa17.26■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 FAM180BQ6P0A1 224 aa17.26■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 SLC48A1Q6P1K1 146 aa17.26■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 FADS6Q8N9I5 356 aa17.26■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 OR2M3Q8NG83 312 aa17.26■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC1Q9BTT6 524 aa17.26■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 NTMT1Q9BV86 223 aa17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms