RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397396.5

TSPAN4-202, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-202ENST00000397396 LRGUKQ96M69 825 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ITPAQ9BY32 194 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 MMP25Q9NPA2 562 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 FRG2CA6NGY1 282 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 CXCR6O00574 342 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ACOX3O15254 700 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 PDE9AO76083 593 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 BCHEP06276 602 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 NUDT7P0C024 238 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 LIFP15018 202 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 C10orf67Q8IYJ2 551 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF248Q8NDW4 579 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 FAM13CQ8NE31 585 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 BBS10Q8TAM1 723 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 TP53INP1Q96A56 240 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 BTBD2Q9BX70 525 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 WWTR1Q9GZV5 400 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 GORASP2Q9H8Y8 452 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 POLE3Q9NRF9 147 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 P4HTMQ9NXG6 502 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 EGFL7Q9UHF1 273 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 IL17BQ9UHF5 180 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 CCDC88CQ9P219 2028 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ARPC2O15144 300 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC28A2O43868 658 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ZFAND5O76080 213 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 IFNA14P01570 189 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 GUSBP08236 651 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 TFPTP0C1Z6 253 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 DRD5P21918 477 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 GABRA3P34903 492 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 POLE2P56282 527 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 RNF4P78317 190 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 PSG6Q00889 435 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 IL10RAQ13651 578 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 TGIF1Q15583 401 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 CYP27C1Q4G0S4 372 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 GLYATQ6IB77 296 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 LCN8Q6JVE9 175 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 C9orf40Q8IXQ3 194 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF321PQ8N8H1 164 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 OR52E4Q8NGH9 312 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 NFKBIDQ8NI38 313 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC38A5Q8WUX1 472 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 KCNE4Q8WWG9 221 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 FIG4Q92562 907 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 CDS1Q92903 461 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 MAL2Q969L2 176 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC35A4Q96G79 324 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM19Q96HH6 336 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 RNF145Q96MT1 663 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 GAL3ST4Q96RP7 486 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 FBXL4Q9UKA2 621 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 OR10H1Q9Y4A9 318 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 A8MVJ9 347 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 H0YHG0 523 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ACOT8O14734 319 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 CLN3Q13286 438 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 GPAT3Q53EU6 434 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 KRT73Q86Y46 540 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ELP5Q8TE02 316 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 PMM1Q92871 262 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 FAM162AQ96A26 154 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 HSPBAP1Q96EW2 488 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 NSMCE2Q96MF7 247 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 G6PC3Q9BUM1 346 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 DEFB126Q9BYW3 111 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 DPH1Q9BZG8 443 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 PCDHAC1Q9H158 963 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF160Q9HCG1 818 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 BCL2L10Q9HD36 194 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 DKK4Q9UBT3 224 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 DTX4Q9Y2E6 619 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 A0A0G2JPF8 293 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 TO15178 435 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ADRB1P08588 477 aa21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms