RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391058.1

RNU6-1177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SULT2B1O00204 365 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCSO14618 274 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF264O43296 627 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TYROBPO43914 113 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AKR7A3O95154 331 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IL4P05112 153 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CLEC3BP05452 202 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 POLBP06746 335 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OR8U8P0C7N1 319 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TCP1P17987 556 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ACKR3P25106 362 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HPDP32754 393 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NF2P35240 595 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NSFP46459 744 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NMUP48645 174 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ERFP50548 548 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MFAP4P55083 255 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRPS1P60891 318 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SULT2A1Q06520 285 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IL10RBQ08334 325 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ABRQ12979 859 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PPP2R5CQ13362 524 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GPR50Q13585 617 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PARP10Q53GL7 1025 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMEM154Q6P9G4 183 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPINT4Q6UDR6 99 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CLEC4GQ6UXB4 293 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM220AQ7Z4H9 259 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HOMEZQ8IX15 550 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMEM252Q8N6L7 170 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PDILTQ8N807 584 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OR9A1PQ8NGU1 263 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FNDC8Q8TC99 324 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TCP11Q8WWU5 503 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LPGAT1Q92604 370 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 USP6NLQ92738 828 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RNF157Q96PX1 679 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ERGIC2Q96RQ1 377 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF607Q96SK3 696 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PKMYT1Q99640 499 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C19orf43Q9BQ61 176 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF416Q9BWM5 594 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 VIPAS39Q9H9C1 493 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMOD3Q9NYL9 352 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UVRAGQ9P2Y5 699 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GNPTGQ9UJJ9 305 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF222Q9UK12 451 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ETV7Q9Y603 341 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TRIP11Q15643 1979 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LAMB4A4D0S4 1761 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 STRCP1A6NGW2 1772 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CACNA1EQ15878 2313 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MYO1GB0I1T2 1018 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF263O14978 683 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AP5Z1O43299 807 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AHCYL1O43865 530 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HCN1O60741 890 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SDC3O75056 442 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TBX10O75333 385 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GBAP04062 536 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LINGO3P0C6S8 592 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TLX1NBP0CAT3 122 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGLL1P15814 213 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PFKFB1P16118 471 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CYP11B2P19099 503 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 EPORP19235 508 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SSTR1P30872 391 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HSD17B3P37058 310 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GNALP38405 381 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UBXN2AP68543 259 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PITPNAQ00169 270 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PUDPQ08623 228 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SMARCB1Q12824 385 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CEACAM7Q14002 265 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AANATQ16613 207 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HKDC1Q2TB90 917 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMEM255AQ5JRV8 349 aa-0.65□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms