RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371219.2

RBM38-204, Transcript of RNA binding motif protein 38, human

TSL 2 BASIC

Gene RBM38, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM38-204	ENST00000371219		A0A096LPI6	279 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	NR5A2	O00482	541 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	NME2P1	O60361	137 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	PPM1B	O75688	479 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	OR6B1	O95007	311 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	FAM107A	O95990	144 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	AK1	P00568	194 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	NME2	P22392	152 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	SOAT1	P35610	550 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	GAB1	Q13480	694 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	TP53BP2	Q13625	1128 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	EFR3A	Q14156	821 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	SAXO2	Q658L1	398 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	AMER2	Q8N7J2	671 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	DOK4	Q8TEW6	326 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	NUDT8	Q8WV74	236 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	GTF2H4	Q92759	462 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	HHATL	Q9HCP6	504 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	CNIH4	Q9P003	139 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	NIN	Q8N4C6	2090 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219		C9JVG2	144 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	ANGPT2	O15123	496 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	KCNH1	O95259	989 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	KRT75	O95678	551 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	ALOX5	P09917	674 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	CAPN3	P20807	821 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	KRT20	P35900	424 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	PIGA	P37287	484 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	PNLIPRP2	P54317	469 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	CORO7	P57737	925 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	SNTA1	Q13424	505 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	DECR1	Q16698	335 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF766	Q5HY98	468 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	DPP10	Q8N608	796 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	VPS33A	Q96AX1	596 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	OMA1	Q96E52	524 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	MAGED4	Q96JG8	741 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	BTBD2	Q9BX70	525 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	FAM107B	Q9H098	131 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	PIGU	Q9H490	435 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	EQTN	Q9NQ60	294 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	CBLC	Q9ULV8	474 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM38-204	ENST00000371219	TSPAN2	O60636	221 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	NPPA	P01160	153 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SP1	P08047	785 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	GUSB	P08236	651 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	PTPN6	P29350	595 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	IL12B	P29460	328 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	MAN2A2	P49641	1150 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	KHK	P50053	298 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	PRKAG1	P54619	331 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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