RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 EPS8L2Q9H6S3 715 aa27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 GPATCH2Q9NW75 528 aa27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 CFL2Q9Y281 166 aa27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 SNX13Q9Y5W8 968 aa27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 MED13Q9UHV7 2174 aa27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 LOC400499M0QZD8 3231 aa27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 MYBPC3Q14896 1274 aa27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 EBPQ15125 230 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 LCN8Q6JVE9 175 aa27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 SERPINA11Q86U17 422 aa27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 GAL3ST4Q96RP7 486 aa27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 TPT1P8Q9HAU6 139 aa27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 FOLH1BQ9HBA9 442 aa27.41■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 DOCK10Q96BY6 2186 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 FAM220BPB1ANY3 271 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 ZFAND5O76080 213 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 AP2B1P63010 937 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 SNCBQ16143 134 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 MFSD12Q6NUT3 480 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 GOLM1Q8NBJ4 401 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 OR2T12Q8NG77 320 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 OR8K3Q8NH51 312 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 OR10A6Q8NH74 314 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 C16orf58Q96GQ5 468 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 YIPF4Q9BSR8 244 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA9Q9BWV2 254 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 ITPAQ9BY32 194 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 WWTR1Q9GZV5 400 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 KCNMB2Q9Y691 235 aa27.4■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa27.39■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 ITGA3P26006 1051 aa27.39■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 GZMMP51124 257 aa27.39■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 CASP9P55211 416 aa27.39■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 RPS26P62854 115 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 IFNEQ86WN2 208 aa27.39■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35G5Q96KT7 338 aa27.39■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 VSTM2LQ96N03 204 aa27.39■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa27.39■■□□□ 1.98
ECHS1-201ENST00000368547 AQP12BA6NM10 295 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 C8BP07358 591 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 ZFP1Q6P2D0 407 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 AQP12AQ8IXF9 295 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO30Q8TB52 745 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 SLC26A7Q8TE54 656 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 KRT36O76013 467 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 KRT75O95678 551 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 PRIM2P49643 509 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 CXADRP78310 365 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 RNF130Q86XS8 419 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 GALNT16Q8N428 558 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 CDRT4Q8N9R6 151 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 OR5L2Q8NGL0 311 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 NUBPLQ8TB37 319 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 ADIPOR1Q96A54 375 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 LRGUKQ96M69 825 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 ACTRT3Q9BYD9 372 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 LHPPQ9H008 270 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 RAD21L1Q9H4I0 556 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 S100A14Q9HCY8 104 aa27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM200CA6NKL6 621 aa27.37■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 ARPC2O15144 300 aa27.37■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 MATN1P21941 496 aa27.37■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 SIRT6Q8N6T7 355 aa27.37■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 PSMF1Q92530 271 aa27.37■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 SERHL2Q9H4I8 314 aa27.37■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 EGFL7Q9UHF1 273 aa27.37■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa27.37■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 ELOVL7A1L3X0 281 aa27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJB5O75953 348 aa27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 SOX8P57073 446 aa27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 RHDQ02161 417 aa27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 RCN1Q15293 331 aa27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 NNATQ16517 81 aa27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 FCRLBQ6BAA4 426 aa27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 TCTN3Q6NUS6 607 aa27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 SLC16A11Q8NCK7 471 aa27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 HIPK4Q8NE63 616 aa27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 SLC9A6Q92581 669 aa27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 A6NL46 340 aa27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.2 ms