RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAMLGP49069 296 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 FNTAP49354 379 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGDIBP52566 201 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 GMFBP60983 142 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZP4Q12836 540 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 KARSQ15046 597 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 LTB4RQ15722 352 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZSWIM7Q19AV6 140 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 LDLRAP1Q5SW96 308 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 MARC1Q5VT66 337 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRR5LQ6MZQ0 368 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 IRGCQ6NXR0 463 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNCKQ6P2M8 343 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q6ZR54 194 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS36Q86VN1 386 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD177Q8N6Q3 437 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1R16AQ96I34 528 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 C9orf85Q96MD7 179 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 RANBP9Q96S59 729 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNK16Q96T55 309 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM114A2Q9NRY5 505 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC7A10Q9NS82 523 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 SOHLH2Q9NX45 425 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF115Q9Y4L5 304 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE4BO95155 1302 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTC26A0AVF1 554 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCT8L1PA6NM43 557 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHOX2AO14813 284 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 TOXO94900 526 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXB7P09629 217 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 UMPSP11172 480 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPN6P29350 595 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHRNA3P32297 505 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 HTR5AP47898 357 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 STK19P49842 368 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 METAP1P53582 386 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPIAP62937 165 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL1RL1Q01638 556 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCE1EQ5T753 118 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAET1GQ6H3X3 334 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 LEG1Q6P5S2 330 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 VITQ6UXI7 678 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 GCNT7Q6ZNI0 430 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC36Q8IYA8 594 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPAG16Q8N0X2 631 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 CERS5Q8N5B7 392 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00612Q8N6U2 182 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 MINDY2Q8NBR6 621 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNNM3Q8NE01 707 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM71CQ8NEG0 241 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 FNDC8Q8TC99 324 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 GTSF1Q8WW33 167 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 NCLNQ969V3 563 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 TADA1Q96BN2 335 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A36Q96CQ1 311 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSD3B7Q9H2F3 369 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACTR8Q9H981 624 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 NGBQ9NPG2 151 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLRF1Q9NZS2 232 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 MBD2Q9UBB5 411 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 GHRLQ9UBU3 117 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 E9PMD0 336 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 H3BTX0 84 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 SGK494L7N484 410 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDXKO00764 312 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALOX15BO15296 676 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 GJB5O95377 273 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALPIP09923 528 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 CT45A10P0DMU9 189 aa2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms