RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361530.10

CNKSR1-201, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNKSR1, Length 2,625 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1-201ENST00000361530 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CSF3P09919 207 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ACP2P11117 423 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 MYL12AP19105 171 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 NTSP30990 170 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SSTR4P31391 388 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 DRD3P35462 400 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 DDOSTP39656 456 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 HOXC5Q00444 222 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SLC9A5Q14940 896 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 PLK5Q496M5 336 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CCDC58Q4VC31 144 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 KLHL22Q53GT1 634 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 VRK2Q86Y07 508 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 FAM181AQ8N9Y4 354 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SUSD6Q92537 303 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 HDAC8Q9BY41 377 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 FABP12A6NFH5 140 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 PRODHO43272 600 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 PCDH8O95206 1070 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 LIMS3P0CW19 117 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 LIMS4P0CW20 117 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CHRNEQ04844 493 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ZIC1Q15915 447 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 KIAA1211LQ6NV74 962 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CLDN22Q8N7P3 220 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 EQTNQ9NQ60 294 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 KCNK6Q9Y257 313 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.6□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 LALBAP00709 142 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 NR2F6P10588 404 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ENPP1P22413 925 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SOX18P35713 384 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 MTNR1AP48039 350 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 HTRA3P83110 453 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 FABP5Q01469 135 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 TPBGQ13641 420 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SLC27A4Q6P1M0 643 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 RTL10Q7L3V2 364 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 LHFPL3Q86UP9 236 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SIX5Q8N196 739 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 LINC00471Q8N535 108 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 OR52P1PQ8NH57 321 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 KCTD7Q96MP8 289 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 A0A0G2JPF8 293 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 FAM170BA6NMN3 283 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 AIFM1O95831 613 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CH25HO95992 272 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 WASP42768 502 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SLC9A3P48764 834 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 TAS2R41P59536 307 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CD83Q01151 205 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SCN1BQ07699 218 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 RAB40BQ12829 278 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ZNF311Q5JNZ3 666 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 TEX47Q8TBZ9 253 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 PINK1Q9BXM7 581 aa14.59□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 PRRG3Q9BZD7 231 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms