RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 FBXO27Q8NI29 283 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 ZFP90Q8TF47 636 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 MAGED4Q96JG8 741 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 LPAR4Q99677 370 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 BTBD10Q9BSF8 475 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 RUBCNLQ9H714 662 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 CLIC1O00299 241 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 CPOXP36551 454 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 MGAT2Q10469 447 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 SAXO2Q658L1 398 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 NANOGP8Q6NSW7 305 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 DEFB107AQ8IZN7 70 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 OR2L13Q8N349 312 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 MORN4Q8NDC4 146 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 NUP43Q8NFH3 380 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 OR7G2Q8NG99 324 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 NEURL3Q96EH8 262 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 FBXL20Q96IG2 436 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 MS4A4EQ96PG1 132 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 LHPPQ9H008 270 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 NANOGQ9H9S0 305 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 TPT1P8Q9HAU6 139 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 TAS2R1Q9NYW7 299 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 NTMQ9P121 344 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.77□□□□□ -0.04
IFT20-201ENST00000322326 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 A0A1B0GUH1 482 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 UPK1AO00322 258 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 SOCS6O14544 535 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 PRAMEF2O60811 474 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 ZG16O60844 167 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 CT62P0C5K7 136 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 SLC6A2P23975 617 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 PRIM2P49643 509 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 SLC7A2P52569 658 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 PRKAG1P54619 331 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 FUT7Q11130 342 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 C6orf120Q7Z4R8 191 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 OR7G1Q8NGA0 311 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 ZNF639Q9UID6 485 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 GMEB1Q9Y692 573 aa14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 ABCA12Q86UK0 2595 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 PRSS44E7EML9 344 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 CBX7O95931 251 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 STSP08842 583 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 MAGEA8P43361 318 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 KHKP50053 298 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 MTPNP58546 118 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 RABL3Q5HYI8 236 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 ARHGAP24Q8N264 748 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-201ENST00000322326 BCORP1Q8N888 145 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms