RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 HBA1P69905 142 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 CLEC18BQ6UXF7 455 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 NUP54Q7Z3B4 507 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 CLEC18CQ8NCF0 446 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 CEP70Q8NHQ1 597 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 C16orf58Q96GQ5 468 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 GPR137Q96N19 417 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 NODALQ96S42 347 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 EBF4Q9BQW3 602 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 NPIPA5E9PKD4 350 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 CASP3P42574 277 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 TMED10P49755 219 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 KCNK10P57789 538 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 PLCXD2Q0VAA5 305 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 HYAL4Q2M3T9 481 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 SPANXN4Q5MJ08 99 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 FNDC7Q5VTL7 733 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 NXNQ6DKJ4 435 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 TMEM81Q6P7N7 255 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 CLECL1Q8IZS7 167 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 OR52N2Q8NGI0 321 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 SLC35A4Q96G79 324 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 MARK4Q96L34 752 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ANGPTL4Q9BY76 406 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 TTTY12Q9BZ98 90 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 NPIPA1Q9UND3 350 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 NCKAP5O14513 1909 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 OR6C70A6NIJ9 312 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 LRRC3CA6NJW4 275 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 C9JVG2 144 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 TP53I11O14683 189 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ASNA1O43681 348 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 HS6ST1O60243 411 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 DIAPH2O60879 1101 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ZNF24P17028 368 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 PRKAG1P54619 331 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 GTF3C1Q12789 2109 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 CMPK2Q5EBM0 449 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 RNF138Q8WVD3 245 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 DIO2Q92813 273 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 C3orf14Q9HBI5 128 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 MED4Q9NPJ6 270 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 SEC14L3Q9UDX4 400 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ZNF407Q9C0G0 2248 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 GXYLT2A0PJZ3 443 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ADAM10O14672 748 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 EDF1O60869 148 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 REM1O75628 298 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 NKX2-2O95096 273 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 UNC5CO95185 931 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 RFPL3SP0C7P2 107 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ACP2P11117 423 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 KIR3DL1P43629 444 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 AQP5P55064 265 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 CYP27C1Q4G0S4 372 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 KRTCAP3Q53RY4 240 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 MFSD12Q6NUT3 480 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 GK5Q6ZS86 529 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 FGD2Q7Z6J4 655 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 SLC16A11Q8NCK7 471 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 COL21A1Q96P44 957 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ADOQ96SZ5 270 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 IL1RL2Q9HB29 575 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 EQTNQ9NQ60 294 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 GPATCH2Q9NW75 528 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 E9PBE3 544 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ZNHIT1O43257 154 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1D-16P01601 117 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 IDO1P14902 403 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 GABRA3P34903 492 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 CCT3P49368 545 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 DGKQP52824 942 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 PNLIPRP2P54317 469 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 PPIAP62937 165 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 PSPHP78330 225 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 TMEM251Q8N6I4 163 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 CDRT4Q8N9R6 151 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 PIK3R3Q92569 461 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 MS4A4EQ96PG1 132 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 PLSCR2Q9NRY7 297 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 CBLCQ9ULV8 474 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 HRH3Q9Y5N1 445 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC13O75165 2243 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 TTC36A6NLP5 189 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 FAM166BA8MTA8 275 aa20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms