RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	TAP2	Q03519	686 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	KCNC3	Q14003	757 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	GPAT4	Q86UL3	456 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	GPR135	Q8IZ08	494 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	FZD8	Q9H461	694 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	HHATL	Q9HCP6	504 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	RNF181	Q9P0P0	153 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM227A	F5H4B4	570 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	CXCL11	O14625	94 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	EBLN1	P0CF75	366 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	ELK1	P19419	428 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	CTNNB1	P35222	781 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	HSPB3	Q12988	150 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	DUSP4	Q13115	394 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	BEND4	Q6ZU67	534 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	ELP4	Q96EB1	424 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	HRH4	Q9H3N8	390 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	ITGA10	O75578	1167 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	TSPAN12	O95859	305 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	LPL	P06858	475 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	ODC1	P11926	461 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	EPCAM	P16422	314 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	BDKRB1	P46663	353 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	KCNJ5	P48544	419 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	PTH2R	P49190	550 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	PRKX	P51817	358 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	E2F1	Q01094	437 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	PRKCZ	Q05513	592 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	GBX1	Q14549	363 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	KCTD11	Q693B1	232 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	PIGX	Q8TBF5	258 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	ST7L	Q8TDW4	575 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	RAB8B	Q92930	207 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	LRRC72	A6NJI9	287 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM74A7	A6NL05	159 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	GABRP	O00591	440 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	B4GALT3	O60512	393 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	FZD7	O75084	574 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	C6orf47	O95873	294 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	ADA	P00813	363 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	PFKM	P08237	780 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	LAMP1	P11279	417 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	PRKAR1B	P31321	381 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	PBX3	P40426	434 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	PPT1	P50897	306 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	APOOL	Q6UXV4	268 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM159	Q96B96	161 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	TREX1	Q9NSU2	369 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	AHSP	Q9NZD4	102 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	NHS	Q6T4R5	1651 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895		H3BSH0	61 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	IFNA17	P01571	189 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	MB	P02144	154 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	IFNA6	P05013	189 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	EDN1	P05305	212 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	PYCR1	P32322	319 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	GRB14	Q14449	540 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-231	ENST00000639895	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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