RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 MZB1Q8WU39 189 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC115Q96NT0 180 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 GABRR3A8MPY1 467 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 IGLV3-27P01718 113 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 YES1P07947 543 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 SPARCP09486 303 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 PRKCAP17252 672 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 SPHARQ15513 63 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 C4orf46Q504U0 113 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 CBLL1Q75N03 491 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ELP5Q8TE02 316 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 A6NIZ1 184 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 OR7A17O14581 309 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 SCO2O43819 266 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 IFNA21P01568 189 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 CTSCP53634 463 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 RAP1BP61224 184 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 RAP1AP62834 184 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 OR2T4Q8NH00 348 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF480Q8WV37 535 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 RFT1Q96AA3 541 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 FEVQ99581 238 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 SLC30A3Q99726 388 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 KCNK12Q9HB15 430 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 CHP2O43745 196 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 CXCL10P02778 98 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 SGSHP51688 502 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 MLLT10P55197 1068 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 DCAF7P61962 342 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 REEP5Q00765 189 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 LRR1Q96L50 414 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF597Q96LX8 424 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 CXCL16Q9H2A7 254 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF69Q9UC07 566 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD28O15084 1053 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 XPNPEP2O43895 674 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 KDM4BO94953 1096 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 MMP12P39900 470 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 GNG2P59768 71 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ARPC4P59998 168 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ERVFC1P60507 584 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 CXCR4P61073 352 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 MS4A2Q01362 244 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 RPE65Q16518 533 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 OCLNQ16625 522 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 DCST2Q5T1A1 773 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 SHFQ7M4L6 423 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 TCTN2Q96GX1 697 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-228ENST00000636120 FRMD6Q96NE9 622 aa6.12□□□□□ -1.43
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