RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.56□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 DBF4BQ8NFT6 615 aa6.56□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 DCUN1D4Q92564 292 aa6.56□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 FEVQ99581 238 aa6.56□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 SIX4Q9UIU6 781 aa6.56□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.56□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 HLA-DQB2P05538 268 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 UQCRC2P22695 453 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 MICAQ29983 383 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 LRRC26Q2I0M4 334 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM200AQ86VY9 491 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 KLBQ86Z14 1044 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 LRR1Q96L50 414 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 IL20Q9NYY1 176 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 AGAP14A8MT82 685 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 HAS3O00219 553 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 CCL22O00626 93 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 TNFRSF10BO14763 440 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 B4GAT1O43505 415 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ALPLP05186 524 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ALPIP09923 528 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 LMO2P25791 158 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 OXTRP30559 389 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ETV5P41161 510 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ASAH1Q13510 395 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 DGKZQ13574 1117 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 PQLC3Q8N755 202 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 OR6K2Q8NGY2 324 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ELP5Q8TE02 316 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 NEURL2Q9BR09 285 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 KATNBL1Q9H079 304 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 TLR9Q9NR96 1032 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 A6NL46 340 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 M0R129 80 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ADAM23O75077 832 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 OR8U9P0C7N5 309 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 CD1DP15813 335 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 S100A11P31949 105 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF709Q8N972 641 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 MARC2Q969Z3 335 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 CD244Q9BZW8 370 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 LRFN1Q9P244 771 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 GMEB2Q9UKD1 530 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 GGT3PA6NGU5 568 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 LOC730098B7Z3J9 87 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 AIPO00170 330 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 MBP02144 154 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 CAPNS1P04632 268 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 FGF4P08620 206 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 AKAIN1P0CW23 69 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 SHMT2P34897 504 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 TGM4P49221 684 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 NRLP54845 237 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 CHRNEQ04844 493 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 TCTE1Q5JU00 501 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 LINGO4Q6UY18 593 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM135Q86UB9 458 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 RTP4Q96DX8 246 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 OR2AG1Q9H205 316 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 POT1Q9NUX5 634 aa6.55□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms