RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-221ENST00000597512 ENTHD1Q8IYW4 607 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-221ENST00000597512 SIMC1Q8NDZ2 872 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-221ENST00000597512 RASSF1Q9NS23 344 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-221ENST00000597512 UCKL1Q9NWZ5 548 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-221ENST00000597512 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-221ENST00000597512 CHST10O43529 356 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-221ENST00000597512 PDX1P52945 283 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-221ENST00000597512 WDR45BQ5MNZ6 344 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-221ENST00000597512 LAIR1Q6GTX8 287 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-221ENST00000597512 NIPAL1Q6NVV3 410 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-221ENST00000597512 OR6T1Q8NGN1 323 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-221ENST00000597512 TGM7Q96PF1 710 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-221ENST00000597512 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-221ENST00000597512 SLC13A4Q9UKG4 626 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-221ENST00000597512 TLCD2A6NGC4 264 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 RHPN2P1A8MT19 583 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 PCDHGA12O60330 932 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 PLOD3O60568 738 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ADAP00813 363 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 IFI6P09912 130 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 GSSP48637 474 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 MAPK10P53779 464 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 EPHA4P54764 986 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 PIGFQ07326 219 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 SEC23BQ15437 767 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 MLIPQ5VWP3 458 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 KLHL17Q6TDP4 642 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 FAM81AQ8TBF8 368 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF675Q8TD23 568 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 FNDC11Q9BVV2 318 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 MGAT4BQ9UQ53 548 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 RNF6Q9Y252 685 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 I3L1I5 382 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ACP2P11117 423 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 SLC5A2P31639 672 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 GFERP55789 205 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 DUSP5Q16690 384 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 VRK2Q86Y07 508 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 OR13F1Q8NGS4 319 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 UBE2FQ969M7 185 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ISOC1Q96CN7 298 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 PRRC1Q96M27 445 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 CCDC90BQ9GZT6 254 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 RAB33BQ9H082 229 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ADAP2Q9NPF8 381 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 PRDM6Q9NQX0 595 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 SOHLH2Q9NX45 425 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 PLCL2Q9UPR0 1127 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 A0A1W2PRQ8 180 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 OR10H3O60404 316 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 FAM20BO75063 409 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 WBP4O75554 376 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 PRKAR1BP31321 381 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 CSNK2BP67870 215 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 SLC35A2P78381 396 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 DMWDQ09019 674 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 LSAMPQ13449 338 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 DGCR6Q14129 220 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 FRRS1Q6ZNA5 592 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 DEPDC4Q8N2C3 294 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 APH1BQ8WW43 257 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ZG16BQ96DA0 208 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ZDHHC12Q96GR4 267 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 MPP4Q96JB8 637 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ARHGDIGQ99819 225 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 FUZQ9BT04 418 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 PIGUQ9H490 435 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 DUSP21Q9H596 190 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 IRAK4Q9NWZ3 460 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 MAT2BQ9NZL9 334 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 FCMRO60667 390 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 MED26O95402 600 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 SLC35E2P0CK97 266 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 RNH1P13489 461 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 KRT20P35900 424 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 GABRA4P48169 554 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 TUBA3CQ13748 450 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 P3H2Q8IVL5 708 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 CDRT4Q8N9R6 151 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF540Q8NDQ6 660 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 OR52P1PQ8NH57 321 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 DOK4Q8TEW6 326 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF285Q96NJ3 590 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-221ENST00000597512 PDE7BQ9NP56 450 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms