RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.22□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.22□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 CIB4A0PJX0 185 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 OR2A25A4D2G3 310 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.21□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 SLITRK5O94991 958 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 YES1P07947 543 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 JUNDP17535 347 aa14.21□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 OXR1Q8N573 874 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 OR4E2Q8NGC2 313 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 PBX4Q9BYU1 374 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.21□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 HMGN4O00479 90 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 NDUFS4O43181 175 aa14.21□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 CCNB2O95067 398 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 ARAFP10398 606 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 XCR1P46094 333 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 CCR8P51685 355 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 LBX1P52954 281 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.21□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 REEP3Q6NUK4 255 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 ARSKQ6UWY0 536 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 PGBD3Q8N328 593 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 FBXL12Q9NXK8 326 aa14.21□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.21□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.21□□□□□ -0.14
CTIF-205ENST00000587860 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.21□□□□□ -0.14
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CTIF-205ENST00000587860 ZNF675Q8TD23 568 aa14.21□□□□□ -0.14
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CTIF-205ENST00000587860 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.14
CTIF-205ENST00000587860 KAT2AQ92830 837 aa14.21□□□□□ -0.14
CTIF-205ENST00000587860 MENTQ9BUN1 341 aa14.21□□□□□ -0.14
CTIF-205ENST00000587860 OR51I1Q9H343 314 aa14.21□□□□□ -0.14
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CTIF-205ENST00000587860 CORO2BQ9UQ03 480 aa14.21□□□□□ -0.14
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CTIF-205ENST00000587860 A0A1W2PQU0 124 aa14.2□□□□□ -0.14
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CTIF-205ENST00000587860 NR2F1P10589 423 aa14.2□□□□□ -0.14
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CTIF-205ENST00000587860 CERS1P27544 350 aa14.2□□□□□ -0.14
CTIF-205ENST00000587860 BCL6P41182 706 aa14.2□□□□□ -0.14
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CTIF-205ENST00000587860 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.2□□□□□ -0.14
CTIF-205ENST00000587860 TMEM107Q6UX40 140 aa14.2□□□□□ -0.14
CTIF-205ENST00000587860 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.2□□□□□ -0.14
CTIF-205ENST00000587860 KCT2Q8NC54 265 aa14.2□□□□□ -0.14
CTIF-205ENST00000587860 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
CTIF-205ENST00000587860 COX14Q96I36 57 aa14.2□□□□□ -0.14
CTIF-205ENST00000587860 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
CTIF-205ENST00000587860 GLIPR2Q9H4G4 154 aa14.2□□□□□ -0.14
CTIF-205ENST00000587860 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.2□□□□□ -0.14
CTIF-205ENST00000587860 IFT22Q9H7X7 185 aa14.2□□□□□ -0.14
CTIF-205ENST00000587860 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.2□□□□□ -0.14
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