RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	DOK6	Q6PKX4	331 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZSR6	202 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TLCD1	Q96CP7	247 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	VPS35	Q96QK1	796 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	COPS8	Q99627	209 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GPR21	Q99679	349 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GPR22	Q99680	433 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	OR2AG1	Q9H205	316 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	COL6A3	P12111	3177 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PR77	199 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CHUK	O15111	745 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PFDN6	O15212	129 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	GRID2	O43424	1007 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TYROBP	O43914	113 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	RHOBTB1	O94844	696 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	AP2A2	O94973	939 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	KCNK5	O95279	499 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SP9	P0CG40	484 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	RALB	P11234	206 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	FCGR1A	P12314	374 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	STMN1	P16949	149 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CD9	P21926	228 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TEAD1	P28347	426 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	BDKRB2	P30411	391 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	AKT2	P31751	481 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CCR7	P32248	378 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	DSCR9	P59020	149 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	RAB10	P61026	200 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	EGR4	Q05215	589 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	DLG1	Q12959	904 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	GRIK2	Q13002	908 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CDC16	Q13042	620 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CTF1	Q16619	201 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	RAPH1	Q70E73	1250 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74

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