RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557679.5

ZNF410-223, Transcript of zinc finger protein 410, human

TSL 5

Gene ZNF410, Length 846 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF410-223	ENST00000557679	CEBPE	Q15744	281 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	NTRK2	Q16620	822 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679		Q6ZSR9	355 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	HDX	Q7Z353	690 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	MDGA2	Q7Z553	956 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	SYT9	Q86SS6	491 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	AMER2	Q8N7J2	671 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	OR2M7	Q8NG81	312 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	DOK4	Q8TEW6	326 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	DIO2	Q92813	273 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	RELT	Q969Z4	430 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF597	Q96LX8	424 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	TSSK3	Q96PN8	268 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	DOHH	Q9BU89	302 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	REEP4	Q9H6H4	257 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	LDAH	Q9H6V9	325 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	EXO5	Q9H790	373 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679		Q9N2J8	555 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	THAP1	Q9NVV9	213 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF639	Q9UID6	485 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	KALRN	O60229	2985 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	OR14I1	A6ND48	311 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	TMEM233	B4DJY2	109 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	PLOD2	O00469	737 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	CCL21	O00585	134 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	BCKDK	O14874	412 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	T	O15178	435 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	AKAP10	O43572	662 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	SUSD5	O60279	629 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	TBX19	O60806	448 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	REM1	O75628	298 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	LRAT	O95237	230 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	CBX7	O95931	251 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	CLPS	P04118	112 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	CCL3	P10147	92 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	BCKDHA	P12694	445 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	SDC1	P18827	310 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	S1PR1	P21453	382 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	ABCD3	P28288	659 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	PTGS2	P35354	604 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	CA7	P43166	264 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	PRR5	P85299	388 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	MGAT2	Q10469	447 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	SNTA1	Q13424	505 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	EFR3A	Q14156	821 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	LTB4R	Q15722	352 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	XKR7	Q5GH72	579 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	CPTP	Q5TA50	214 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ZNF410-223	ENST00000557679	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		6.06	□□□□□ -1.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms