RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC35E2P0CK97 266 aa17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARRB2P32121 409 aa17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GSTM5P46439 218 aa17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FOXA1P55317 472 aa17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EBPQ15125 230 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPDYAQ5MJ70 313 aa17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM198Q66K66 360 aa17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SEM1Q6ZVN7 128 aa17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TP53INP1Q96A56 240 aa17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNA7Q96RP8 456 aa17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RASSF1Q9NS23 344 aa17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MCM8Q9UJA3 840 aa17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TIMM22Q9Y584 194 aa17.79■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM120BA0PK00 339 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DVL2O14641 736 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TP53I11O14683 189 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCDH7O60245 1069 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EPPINO95925 133 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UROSP10746 265 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UQCRC1P31930 480 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SERPINB5P36952 375 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRPC1P48995 793 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR4P57081 412 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DUSP8Q13202 625 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DIO2Q92813 273 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF597Q96LX8 424 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACPTQ9BZG2 426 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF446Q9NWS9 450 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRIM1Q9NZV1 1036 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AKAP6Q13023 2319 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNX4O95219 450 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLPSP04118 112 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FGF4P08620 206 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GDF1P27539 372 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TIMP3P35625 211 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ALDH9A1P49189 494 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HTR6P50406 440 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUDCD3Q8IVD9 361 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF441Q8N8Z8 693 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM222BQ8WU58 562 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TIMP4Q99727 224 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNK9Q9NPC2 374 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GIMAP4Q9NUV9 329 aa17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NINQ8N4C6 2090 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PGRMC2O15173 223 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DIAPH2O60879 1101 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAPPC6AO75865 159 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRATO95237 230 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHRNGP07510 517 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DRD2P14416 443 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PORP16435 677 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BMP5P22003 454 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASCL1P50553 236 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XKP51811 444 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HMGCS1Q01581 520 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HEPACAMQ14CZ8 416 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPS6KA2Q15349 733 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTMPQ5BVD1 217 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC48A1Q6P1K1 146 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF165Q6ZSG1 346 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LACC1Q8IV20 430 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GALNT12Q8IXK2 581 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PM20D2Q8IYS1 436 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNIP2Q8NFZ5 429 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KLHL29Q96CT2 875 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms