RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528787.1

SSBP3-211, Transcript of single stranded DNA binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene SSBP3, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3-211ENST00000528787 NUDT2P50583 147 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 CRISP3P54108 245 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 PNLIPRP2P54317 469 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 WNT3P56703 355 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 CXADRP78310 365 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 CBX1P83916 185 aa7.36□□□□□ -1.23
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SSBP3-211ENST00000528787 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 TLR1Q15399 786 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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SSBP3-211ENST00000528787 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 ZNF385BQ569K4 471 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 SAXO2Q658L1 398 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 REP15Q6BDI9 236 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 GK5Q6ZS86 529 aa7.36□□□□□ -1.23
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SSBP3-211ENST00000528787 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 ANKRD46Q86W74 232 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 FUNDC1Q8IVP5 155 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 MISPQ8IVT2 679 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 SLC34A3Q8N130 599 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 ZADH2Q8N4Q0 377 aa7.36□□□□□ -1.23
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SSBP3-211ENST00000528787 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.36□□□□□ -1.23
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SSBP3-211ENST00000528787 GPR151Q8TDV0 419 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 SLC9A6Q92581 669 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 TTC9Q92623 222 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 KAT2AQ92830 837 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 TEX37Q96LM6 180 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 ZNF607Q96SK3 696 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 CGREF1Q99674 301 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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SSBP3-211ENST00000528787 HPF1Q9NWY4 346 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 STMN3Q9NZ72 180 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 CNIH4Q9P003 139 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 ARMCX1Q9P291 453 aa7.36□□□□□ -1.23
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SSBP3-211ENST00000528787 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.36□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.35□□□□□ -1.23
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SSBP3-211ENST00000528787 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.35□□□□□ -1.23
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SSBP3-211ENST00000528787 MLF1P58340 268 aa7.35□□□□□ -1.23
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SSBP3-211ENST00000528787 CYP51A1Q16850 503 aa7.35□□□□□ -1.23
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SSBP3-211ENST00000528787 ACER2Q5QJU3 275 aa7.35□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 GCNT6Q5T4J0 391 aa7.35□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 FHL5Q5TD97 284 aa7.35□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 SLC2A7Q6PXP3 512 aa7.35□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.35□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 RTL4Q6ZR62 310 aa7.35□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.35□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 PGAM4Q8N0Y7 254 aa7.35□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 MMP21Q8N119 569 aa7.35□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 FITM2Q8N6M3 262 aa7.35□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.35□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.35□□□□□ -1.23
SSBP3-211ENST00000528787 ZFP90Q8TF47 636 aa7.35□□□□□ -1.23
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