RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TINAGQ9UJW2 476 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SOCS5O75159 536 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CISD3P0C7P0 127 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ANXA3P12429 323 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 AVPR2P30518 371 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 AVPR1BP47901 424 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MTAPQ13126 283 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SGO1Q5FBB7 561 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 OR9Q2Q8NGE9 314 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CREB3L1Q96BA8 519 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 KATNB1Q9BVA0 655 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRA2Q9H9E1 313 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 NUDT15Q9NV35 164 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SSR3Q9UNL2 185 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 NCR1O76036 304 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 WDPCPO95876 746 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 APOC3P02656 99 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PTPN6P29350 595 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 GPR176Q14439 515 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 HSD17B12Q53GQ0 312 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PDSS1Q5T2R2 415 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 M0R233 179 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 HK1P19367 917 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 STOMP27105 288 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 INPP1P49441 399 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CRYBA2P53672 197 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SEMG2Q02383 582 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MPEG1Q2M385 716 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TSSK4Q6SA08 328 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 NXPE2Q96DL1 559 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 C7orf34Q96L11 122 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SARGQ9BW04 601 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 FOLH1BQ9HBA9 442 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SGK2Q9HBY8 427 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SH3BP4Q9P0V3 963 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 A8MXK9 166 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 KPNA5O15131 536 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TSPAN6O43657 245 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 DNASE1P24855 282 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 KDELR2P33947 212 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 GDI2P50395 445 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 AP1S2P56377 157 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA1024LP59773 190 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC157Q569K6 752 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 NHLRC3Q5JS37 347 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PAQR7Q86WK9 346 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TMIEQ8NEW7 156 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 EMC7Q9NPA0 242 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFB11Q9NX14 153 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SLC39A1Q9NY26 324 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CCL27Q9Y4X3 112 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ARL5AQ9Y689 179 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 G3V3Q6 166 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 GJB3O75712 270 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TFPIP10646 304 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SLC6A1P30531 599 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 FEN1P39748 380 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CAPZA2P47755 286 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MEOX2P50222 304 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SUOXP51687 545 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CNTN1Q12860 1018 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MRNIPQ6NTE8 343 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SOSTQ9BQB4 213 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CLMPQ9H6B4 373 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 BPIFA1Q9NP55 256 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TSC2P49815 1807 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PQU0 124 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ENTPD6O75354 484 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CCNB2O95067 398 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 LGI1O95970 557 aa9.53□□□□□ -0.88
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