RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517052.1

RNU6-448P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 448, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-448P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF254O75437 659 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 RAD51DO75771 328 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 PDE5AO76074 875 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 SUPT7LO94864 414 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 PGK1P00558 417 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGKV1-17P01599 117 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 SEMG1P04279 462 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 HOXB7P09629 217 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 NUDT17P0C025 328 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 H2AFZP0C0S5 128 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 TSPY3P0CV98 308 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 TSPY8P0CW00 308 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 TPBGLP0DKB5 382 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 B4GALT1P15291 398 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 TBPP20226 339 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 CYP3A5P20815 502 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 GABRR1P24046 479 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 SOAT1P35610 550 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 CTRLP40313 264 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 KCNJ1P48048 391 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 POU3F4P49335 361 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 TNFSF10P50591 281 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 METAP1P53582 386 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 NUP107P57740 925 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 PAX5Q02548 391 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 BCL2L1Q07817 233 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 MOBPQ13875 183 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 NFE2L1Q14494 772 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 LY6EQ16553 131 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 HAGHQ16775 308 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 HKDC1Q2TB90 917 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 EPC2Q52LR7 807 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 MPPE1Q53F39 396 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR2B11Q5JQS5 317 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 EOGTQ5NDL2 527 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 DDI2Q5TDH0 399 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 LGSNQ5TDP6 509 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 LRRC38Q5VT99 294 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 UFSP1Q6NVU6 142 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 CASC4Q6P4E1 433 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGFL1Q6UW32 110 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 ATRAIDQ6UW56 229 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 CXCL17Q6UXB2 119 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 LRRC31Q6UY01 552 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZFP2Q6ZN57 461 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 ASPGQ86U10 573 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 ERICH1Q86X53 443 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 CERS3Q8IU89 383 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF547Q8IVP9 402 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM61Q8N0U2 210 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 THEM5Q8N1Q8 247 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 LSMEM1Q8N8F7 131 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZBTB44Q8NCP5 570 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 CCDC191Q8NCU4 936 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR6M1Q8NGM8 313 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 NEIL3Q8TAT5 605 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 UBTD2Q8WUN7 234 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 DEDD2Q8WXF8 326 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 RDH5Q92781 318 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 GGHQ92820 318 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 CORO2AQ92828 525 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 MYDGFQ969H8 173 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 ULK4Q96C45 1275 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 ERO1AQ96HE7 468 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 CXorf58Q96LI9 332 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 CPXM1Q96SM3 734 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 NRTNQ99748 197 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 POLR3GLQ9BT43 218 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 CENPOQ9BU64 300 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 NTMT1Q9BV86 223 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 TM2D1Q9BX74 207 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC26A1Q9H2B4 701 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 VCXQ9H320 206 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 TSPY26PQ9H489 355 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 PTGES2Q9H7Z7 377 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 DCLRE1BQ9H816 532 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 SRD5A3Q9H8P0 318 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 TEKT2Q9UIF3 430 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 ANAPC5Q9UJX4 755 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 PPIAL4AQ9Y536 164 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 CACNG2Q9Y698 323 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-448P-201ENST00000517052 PTPRUQ92729 1446 aa0.36□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms