RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516539.1

RNU6-1256P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1256, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1256P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CCNCP24863 283 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PEX19P40855 299 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EMDP50402 254 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 NDST2P52849 883 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 AIF1P55008 147 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CNTN2Q02246 1040 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ARL16Q0P5N6 197 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PJVKQ0ZLH3 352 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CUL2Q13617 745 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 IDI1Q13907 227 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EMC2Q15006 297 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 HLA-BQ31612 363 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CYBRD1Q53TN4 286 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 C3P1Q6ZMU1 363 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FRRS1Q6ZNA5 592 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ANKRD37Q7Z713 158 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SMIM29Q86T20 159 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CATSPERDQ86XM0 798 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 UBQLNLQ8IYU4 475 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 LMO3Q8TAP4 145 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MRGPRDQ8TDS7 321 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 LHX4Q969G2 390 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MYLPFQ96A32 169 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CCDC77Q9BR77 488 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 OVOL2Q9BRP0 275 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EDEM2Q9BV94 578 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 GPR174Q9BXC1 333 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DGCR6LQ9BY27 220 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ALG9Q9H6U8 611 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FN3KRPQ9HA64 309 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PLEKHA3Q9HB20 300 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 NRN1Q9NPD7 142 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FAM114A2Q9NRY5 505 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PIPOXQ9P0Z9 390 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MBD2Q9UBB5 411 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EMCNQ9ULC0 261 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RPH3ALQ9UNE2 315 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TCF19Q9Y242 345 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RNF115Q9Y4L5 304 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 LRP12Q9Y561 859 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FAM47DPA6NHR8 397 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ASB14A6NK59 587 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RNF212BA8MTL3 300 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 BMPR1BO00238 502 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FBP2O00757 339 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 STX7O15400 261 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DUX1O43812 170 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 NTN1O95631 604 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 IGSF6O95976 241 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 IL1BP01584 269 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 OPN1LWP04000 364 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TOP1P11387 765 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 BCKDHAP12694 445 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CPN1P15169 458 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 HNF1AP20823 631 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 NT5EP21589 574 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TBXA2RP21731 343 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MAP2K2P36507 400 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MMP12P39900 470 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SSR1P43307 286 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DLX5P56178 289 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PEX3P56589 373 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ACTR3P61158 418 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CCNA1P78396 465 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ITPK1Q13572 414 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TFDP1Q14186 410 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 GANABQ14697 944 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF718Q3SXZ3 478 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF585BQ52M93 769 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 UNC50Q53HI1 259 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PHYHD1Q5SRE7 291 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PYHIN1Q6K0P9 492 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SCYL2Q6P3W7 929 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 LCLAT1Q6UWP7 414 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 KIF6Q6ZMV9 814 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF841Q6ZN19 808 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms