RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516016.1

RN7SKP19-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 19, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP19, Length 252 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP19-201ENST00000516016 CETN1Q12798 172 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 IL11RAQ14626 422 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 COX19Q49B96 90 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 METTL11BQ5VVY1 283 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 RHBDD2Q6NTF9 364 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 OR6J1Q8NGC5 347 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 RAET1EQ8TD07 263 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 PIGCQ92535 297 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 LRRC58Q96CX6 371 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 TVP23CQ96ET8 276 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 PDXPQ96GD0 296 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 TBATAQ96M53 351 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 STACQ99469 402 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 SYNCQ9H7C4 482 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 DUX4Q9UBX2 424 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 ITM2BQ9Y287 266 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 ETV7Q9Y603 341 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 FGD5Q6ZNL6 1462 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 RYR2Q92736 4967 aa-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 COL6A3P12111 3177 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 A0A087X0M5 115 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 A0A1B0GX30 115 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 GLOD5A6NK44 160 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 AGAP14A8MT82 685 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 B4E171 279 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 PPIP5K2O43314 1243 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 CLN5O75503 358 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 CSF2P04141 144 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 PCCBP05166 539 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 HSPA4P34932 840 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 TSPAN7P41732 249 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 BTDP43251 543 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 ARF1P84077 181 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 KLHL30Q0D2K2 578 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 BIRC2Q13490 618 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 IRF4Q15306 451 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 CMPK2Q5EBM0 449 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 PAGE3Q5JUK9 113 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 FAM46CQ5VWP2 391 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 CPXCR1Q8N123 301 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 NCOA7Q8NI08 942 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 FOXC2Q99958 501 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 RAB9BQ9NP90 201 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 ESM1Q9NQ30 184 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 PIGVQ9NUD9 493 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 PDRG1Q9NUG6 133 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 DUSP12Q9UNI6 340 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 TENM4Q6N022 2769 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa-0.06□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 RYR3Q15413 4870 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 ADGRL1O94910 1474 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 PGPEP1LA6NFU8 196 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 DHRS7CA6NNS2 312 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 VGLL3A8MV65 326 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 IGHV3-48P01763 117 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 GJB2P29033 226 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 CCR4P51679 360 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 METAP1P53582 386 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 MC1RQ01726 317 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 PUDPQ08623 228 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 PSMD6Q15008 389 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 P2RY14Q15391 338 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 C1orf189Q5VU69 101 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 OR5M10Q6IEU7 315 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 NANOGP8Q6NSW7 305 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 SZRD1Q7Z422 152 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 C17orf64Q86WR6 236 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 DNAAF5Q86Y56 855 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 C12orf56Q8IXR9 622 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 SMYD1Q8NB12 490 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 CCDC197Q8NCU1 140 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 GOLGA5Q8TBA6 731 aa-0.07□□□□□ -2.42
RN7SKP19-201ENST00000516016 FNDC8Q8TC99 324 aa-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms