RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 RDH11Q8TC12 318 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 ZPLD1Q8TCW7 415 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 FMO2Q99518 471 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 TSPYL1Q9H0U9 437 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 VPS29Q9UBQ0 182 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 PRODH2Q9UF12 536 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 TRPS1Q9UHF7 1281 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 UTS2RQ9UKP6 389 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
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HERC3-211ENST00000513325 PRAMEF25A6NGN4 478 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 FRG2CA6NGY1 282 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 MANBAO00462 879 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 NME6O75414 186 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 CBR3O75828 277 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 ESRRBO95718 433 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 IL18BPO95998 194 aa15.4■□□□□ 0.06
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HERC3-211ENST00000513325 CHN1P15882 459 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 DNASE1P24855 282 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 ECHS1P30084 290 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 GCKP35557 465 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 SNTA1Q13424 505 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa15.4■□□□□ 0.06
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HERC3-211ENST00000513325 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 MMGT1Q8N4V1 131 aa15.4■□□□□ 0.06
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HERC3-211ENST00000513325 TUBA1CQ9BQE3 449 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 ANKRA2Q9H9E1 313 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 PFDN4Q9NQP4 134 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 JKAMPQ9P055 326 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 AKAP6Q13023 2319 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 MTORP42345 2549 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ITPR3Q14573 2671 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 TO15178 435 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 REM1O75628 298 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 SUPT7LO94864 414 aa15.39■□□□□ 0.05
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HERC3-211ENST00000513325 KRT6BP04259 564 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
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HERC3-211ENST00000513325 HSD3B2P26439 372 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 KRT6CP48668 564 aa15.39■□□□□ 0.05
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HERC3-211ENST00000513325 SRYQ05066 204 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 FOXF2Q12947 444 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 UNC50Q53HI1 259 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ZNF628Q5EBL2 1059 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 FBXW10Q5XX13 1052 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 TRIM42Q8IWZ5 723 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 CCDC116Q8IYX3 515 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 OR14L1PQ8NHC6 308 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 TMCO6Q96DC7 493 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 COL21A1Q96P44 957 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 OR2B2Q9GZK3 357 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 TMEM216Q9P0N5 145 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 MCM8Q9UJA3 840 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 EDARQ9UNE0 448 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 OR6C70A6NIJ9 312 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 H0Y3Z8 333 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 IL3P08700 152 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
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HERC3-211ENST00000513325 STARP49675 285 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 PPP2R2AP63151 447 aa15.38■□□□□ 0.05
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF678Q5SXM1 525 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ENPP6Q6UWR7 440 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 PLXDC2Q6UX71 529 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 PLCZ1Q86YW0 608 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 OR9A2Q8NGT5 310 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 METTL6Q8TCB7 284 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ZNF675Q8TD23 568 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 KAT2AQ92830 837 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ZNF382Q96SR6 550 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ADOQ96SZ5 270 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 MED12Q93074 2177 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 DLX3O60479 287 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ULK1O75385 1050 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 CT45A8P0DMV1 189 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 CT45A9P0DMV2 189 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 DRD2P14416 443 aa15.37■□□□□ 0.05
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