RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ADAMDEC1O15204 470 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TPST2O60704 377 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 NADKO95544 446 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DLGAP3O95886 979 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CTRB1P17538 263 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ITIH1P19827 911 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RAB8AP61006 207 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SLC35A2P78381 396 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CHRNEQ04844 493 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FADDQ13158 208 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 IL18R1Q13478 541 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SYT16Q17RD7 645 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FAHD1Q6P587 224 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PAGE2Q7Z2X7 111 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 OR8K5Q8NH50 307 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PROX1Q92786 737 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 MUL1Q969V5 352 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TMEM19Q96HH6 336 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 MENTQ9BUN1 341 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TEX101Q9BY14 249 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PSME2Q9UL46 239 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PS29 197 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 POM121BA6NF01 834 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TSPAN4O14817 238 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ZW10O43264 779 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ERI3O43414 337 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RGS10O43665 173 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 B4GALT2O60909 372 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CEACAM5P06731 702 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ARAFP10398 606 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PCMT1P22061 227 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 UQCRC2P22695 453 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TGFBR1P36897 503 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TPMTP51580 245 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TMBIM6P55061 237 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 GABARAPL2P60520 117 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 MVKQ03426 396 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 KEAP1Q14145 624 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 NUDT13Q86X67 352 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RGMAQ96B86 450 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 EPYCQ99645 322 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DPH7Q9BTV6 452 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FGF22Q9HCT0 170 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RNF6Q9Y252 685 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SPTBP11277 2137 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FAM172BPA6NC97 362 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ISM1B1AKI9 464 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 B4E171 279 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CCNKO75909 580 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 GADD45GO95257 159 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DNTTP04053 509 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 OR12D1P0DN82 309 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 IGFALSP35858 605 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TRIM23P36406 574 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TSPAN7P41732 249 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 LSSP48449 732 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RAB28P51157 221 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 VBP1P61758 197 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PPP2CBP62714 309 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PPP2CAP67775 309 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 REEP5Q00765 189 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.6□□□□□ -1.35
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