RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 TOXO94900 526 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 CBX7O95931 251 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 OTCP00480 354 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 F13BP05160 661 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 IL3P08700 152 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 GLI4P10075 376 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 COX6B1P14854 86 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 FOSL1P15407 271 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 PCSK2P16519 638 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 AGAP20933 346 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 GPX3P22352 226 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 GALNSP34059 522 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 PTGDSP41222 190 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ALDH9A1P49189 494 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 MAPK12P53778 367 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 MAP4K2Q12851 820 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 BIKQ13323 160 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 NTRK2Q16620 822 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 OR52E8Q6IFG1 317 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 OGFOD2Q6N063 350 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC48A1Q6P1K1 146 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 MTFR2Q6P444 385 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 METTL6Q8TCB7 284 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 KAT2AQ92830 837 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 NTNG2Q96CW9 530 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 GNRHR2Q96P88 292 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 NODALQ96S42 347 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 SMC6Q96SB8 1091 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 EBPLQ9BY08 206 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ITPAQ9BY32 194 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ACPTQ9BZG2 426 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 LDAHQ9H6V9 325 aa6.7□□□□□ -1.34
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PRPF4B-208ENST00000490653 AHSPQ9NZD4 102 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 EHD3Q9NZN3 535 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 TMCO1Q9UM00 188 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 SNX6Q9UNH7 406 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.69□□□□□ -1.34
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PRPF4B-208ENST00000490653 C1orf226A1L170 272 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 SMIM23A6NLE4 172 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 OR6C76A6NM76 312 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 B4DXG7 233 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ACOT7O00154 380 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 AQP7O14520 342 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 TAC1P20366 129 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 DEKP35659 375 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 CASP3P42574 277 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 MAN2A2P49641 1150 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 EMDP50402 254 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 DLX5P56178 289 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 KCNJ2P63252 427 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 TFF3Q07654 80 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 EIPR1Q53HC9 387 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 LGSNQ5TDP6 509 aa6.69□□□□□ -1.34
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PRPF4B-208ENST00000490653 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.69□□□□□ -1.34
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PRPF4B-208ENST00000490653 DIO2Q92813 273 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 HGDQ93099 445 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ZBTB9Q96C00 473 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 MTBPQ96DY7 904 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ART5Q96L15 291 aa6.69□□□□□ -1.34
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