RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474831.5

LAMTOR4-208, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, human

TSL 3

Gene LAMTOR4, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LAMTOR4-208	ENST00000474831	IGKV1D-16	P01601	117 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CD46	P15529	392 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CDKN2C	P42773	168 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TDGF1P3	P51864	188 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HBA1	P69905	142 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GAB1	Q13480	694 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZAR1	Q86SH2	424 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NUP43	Q8NFH3	380 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HGD	Q93099	445 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	BTBD9	Q96Q07	612 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ASPDH	A6ND91	283 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FRG2C	A6NGY1	282 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAM166B	A8MTA8	275 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ADAM10	O14672	748 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RASAL1	O95294	804 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CELA3A	P09093	270 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SOAT1	P35610	550 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PTGDS	P41222	190 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PPIC	P45877	212 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KCNK10	P57789	538 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NTRK2	Q16620	822 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OPN5	Q6U736	354 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RTL4	Q6ZR62	310 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SIAH3	Q8IW03	269 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR2M7	Q8NG81	312 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TP53INP1	Q96A56	240 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MED4	Q9NPJ6	270 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	UBD	O15205	165 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ATP8B1	O43520	1251 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PPM1B	O75688	479 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DRD5	P21918	477 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MAP3K8	P41279	467 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RFX3	P48380	749 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FOXO1	Q12778	655 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DUSP5	Q16690	384 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GTDC1	Q4AE62	458 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TAGAP	Q8N103	731 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAR1	Q8WVX9	515 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	VPS33A	Q96AX1	596 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TESC	Q96BS2	214 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PRODH2	Q9UF12	536 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		12.78	□□□□□ -0.36
LAMTOR4-208	ENST00000474831		J3QKU1	62 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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