RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 FRKP42685 505 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SLC18A1P54219 525 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 MANFP55145 182 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CORO7P57737 925 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 RPP38P78345 283 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PLCXD2Q0VAA5 305 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 BST1Q10588 318 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PDE7AQ13946 482 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
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SYN3-211ENST00000472027 TMEM198Q66K66 360 aa8.4□□□□□ -1.06
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SYN3-211ENST00000472027 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 OR2L13Q8N349 312 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 MGARPQ8TDB4 240 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 HGDQ93099 445 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 TMBIM1Q969X1 311 aa8.4□□□□□ -1.06
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SYN3-211ENST00000472027 MTERF3Q96E29 417 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PPP1R36Q96LQ0 422 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 VSTM2LQ96N03 204 aa8.4□□□□□ -1.06
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SYN3-211ENST00000472027 NODALQ96S42 347 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SORT1Q99523 831 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 C1orf50Q9BV19 199 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PNPOQ9NVS9 261 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ATP6V1HQ9UI12 483 aa8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ESPL1Q14674 2120 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 A0A1B0GVC2 190 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 OR6C70A6NIJ9 312 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 PDPK1O15530 556 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 TSPAN2O60636 221 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 REM1O75628 298 aa8.39□□□□□ -1.07
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SYN3-211ENST00000472027 IGHG3P01860 377 aa8.39□□□□□ -1.07
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SYN3-211ENST00000472027 CELA3AP09093 270 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 GP1BBP13224 206 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 GPC1P35052 558 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 RPL3P39023 403 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
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SYN3-211ENST00000472027 EMX2Q04743 252 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 HSPB3Q12988 150 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 MTFR2Q6P444 385 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.39□□□□□ -1.07
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SYN3-211ENST00000472027 PACS2Q86VP3 889 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 SLC34A3Q8N130 599 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 OR7A2PQ8NGA2 310 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 FAM57AQ8TBR7 257 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 NUDT8Q8WV74 236 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ARL8AQ96BM9 186 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 NTNG2Q96CW9 530 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 TMCO6Q96DC7 493 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 CCDC120Q96HB5 630 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 RILPQ96NA2 401 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 COL21A1Q96P44 957 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 GNRHR2Q96P88 292 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 PHF12Q96QT6 1004 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ADOQ96SZ5 270 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 LDAHQ9H6V9 325 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 HAO1Q9UJM8 370 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 MEMO1Q9Y316 297 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 LIPGQ9Y5X9 500 aa8.39□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 TENM4Q6N022 2769 aa8.38□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.38□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PRB8 838 aa8.38□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 C2orf72A6NCS6 295 aa8.38□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 NPIPA2E9PIF3 369 aa8.38□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 NPIPA3F8WFD2 350 aa8.38□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 GNB5O14775 395 aa8.38□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 SUSD5O60279 629 aa8.38□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ICOSLGO75144 302 aa8.38□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 PSMG1O95456 288 aa8.38□□□□□ -1.07
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