RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 LGI4Q8N135 537 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF321PQ8N8H1 164 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SIMC1Q8NDZ2 872 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 C17orf47Q8NEP4 570 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 TNIP2Q8NFZ5 429 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 OR10A6Q8NH74 314 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXO27Q8NI29 283 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC9A6Q92581 669 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 TP53INP1Q96A56 240 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 MCUR1Q96AQ8 359 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 OR7D2Q96RA2 312 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CDRT15Q96T59 188 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 LRMDAQ9H2I8 198 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 OR51I1Q9H343 314 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 PIGUQ9H490 435 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 Q9N2J8 555 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 DUSP22Q9NRW4 184 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 EXD2Q9NVH0 621 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CMTM6Q9NX76 183 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCD2Q9UBJ2 740 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ACACAQ13085 2346 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 APC2O95996 2303 aa8.71□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 FRG2CA6NGY1 282 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 EFSO43281 561 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 NKX2-2O95096 273 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CAPNS1P04632 268 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 OR12D1P0DN82 309 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 PRKAR1AP10644 381 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 BMP2P12643 396 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ETFAP13804 333 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 GABRA3P34903 492 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 MAP3K8P41279 467 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 MAN2A2P49641 1150 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 MVDP53602 400 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 NRG3P56975 720 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 NCALDP61601 193 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 LIPEQ05469 1076 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 RBBP4Q09028 425 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SELPLGQ14242 412 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 GNA13Q14344 377 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP51A1Q16850 503 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 COX20Q5RI15 118 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ERICH5Q6P6B1 374 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR155Q7Z3F1 870 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf40Q8IXQ3 194 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TAGAPQ8N103 731 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC5A8Q8N695 610 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 HORMAD2Q8N7B1 307 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 COX18Q8N8Q8 333 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC16A11Q8NCK7 471 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR151Q8TDV0 419 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 XAGE5Q8WWM1 108 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ADIPOR1Q96A54 375 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 HSPBAP1Q96EW2 488 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 BTBD9Q96Q07 612 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 GAL3ST4Q96RP7 486 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 THTPAQ9BU02 230 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ITPAQ9BY32 194 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 WWTR1Q9GZV5 400 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM38AQ9H6F2 299 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 P2RX2Q9UBL9 471 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 LIPT1Q9Y234 373 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 OR10H1Q9Y4A9 318 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 HMGN4O00479 90 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 NME4O00746 187 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TO15178 435 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms