RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460639.2

ATRX-204, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 3

Gene ATRX, Length 461 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-204ENST00000460639 DUX1O43812 170 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 EFNA2O43921 213 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 JAK2O60674 1132 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CABYRO75952 493 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 B3GAT3O94766 335 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 STK17BO94768 372 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 BMP15O95972 392 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 GLAP06280 429 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CT62P0C5K7 136 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 PRKACAP17612 351 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 AMD1P17707 334 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CTNNA2P26232 953 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 RORAP35398 523 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CBX5P45973 191 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 SLC26A2P50443 739 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 SERPINB8P50452 374 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 RAB9AP51151 201 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 MYL6P60660 151 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 PDE1BQ01064 536 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 PPIL2Q13356 520 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 C1orf61Q13536 156 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ITIH4Q14624 930 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 HEPACAMQ14CZ8 416 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 GPR33Q49SQ1 333 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ARMCX4Q5H9R4 360 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 PDSS1Q5T2R2 415 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 LCN1P1Q5VSP4 162 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 OR4A47Q6IF82 309 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ZNF549Q6P9A3 640 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 TTC23LQ6PF05 361 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 C16orf62Q7Z3J2 963 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 COX8CQ7Z4L0 72 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 PAQR7Q86WK9 346 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 PALB2Q86YC2 1186 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 OR1L4Q8NGR5 311 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 OR14A16Q8NHC5 309 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 FAM110BQ8TC76 370 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 DTX3LQ8TDB6 740 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CACNG8Q8WXS5 425 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ADIPOR1Q96A54 375 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 MCUR1Q96AQ8 359 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 MSANTD3Q96H12 275 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ZNF333Q96JL9 665 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 C12orf42Q96LP6 360 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 DUX5Q96PT3 197 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ACCSQ96QU6 501 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CCT8L2Q96SF2 557 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 S1PR3Q99500 378 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 TSC22D3Q99576 134 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 OMDQ99983 421 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 TRIM62Q9BVG3 475 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 LRRC2Q9BYS8 371 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
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ATRX-204ENST00000460639 RGCCQ9H4X1 137 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 C12orf10Q9HB07 376 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 SDHAF3Q9NRP4 125 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 GKN1Q9NS71 199 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 UFSP2Q9NUQ7 469 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 NUDT15Q9NV35 164 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 DDX19BQ9UMR2 479 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ERVK-19Q9WJR5 959 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 PIGLQ9Y2B2 252 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 MEMO1Q9Y316 297 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 OR1A2Q9Y585 309 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.09□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 A0A1B0GVL5 298 aa4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 CD8B2A6NJW9 211 aa4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 C12orf71A8MTZ7 269 aa4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 PRR32B1ATL7 298 aa4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 E5RGE8 158 aa4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 CHEK1O14757 476 aa4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 KRT86O43790 486 aa4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 CLN5O75503 358 aa4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 OR2F2O95006 317 aa4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 TSPAN12O95859 305 aa4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 TOMM40O96008 361 aa4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 APOEP02649 317 aa4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 APRTP07741 180 aa4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 ETS2P15036 469 aa4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 EVI2BP34910 448 aa4.08□□□□□ -1.76
ATRX-204ENST00000460639 ALDH3B1P43353 468 aa4.08□□□□□ -1.76
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