RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 RASL10BQ96S79 203 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SORT1Q99523 831 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 EBPLQ9BY08 206 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PFDN4Q9NQP4 134 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 DEPPQ9NTK1 212 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 VTI1BQ9UEU0 232 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 Q9UFV3 132 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ASB4Q9Y574 426 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 CLDN16Q9Y5I7 305 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 FAM215AQ9Y5M1 114 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 A6NNC1 897 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SYT5O00445 386 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 GUCY1B2O75343 617 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 OR6B1O95007 311 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 KITP10721 976 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 HSD3B1P14060 373 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 HSD3B2P26439 372 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PIK3R1P27986 724 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SERPINB3P29508 390 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SOX3P41225 446 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 MAGEA5P43359 124 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 STT3AP46977 705 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ASCL1P50553 236 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 GPR143P51810 404 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 NAA20P61599 178 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ACSM2AQ08AH3 577 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 KEAP1Q14145 624 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SH2D4BQ5SQS7 431 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 C6orf163Q5TEZ5 329 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ACSM2BQ68CK6 577 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 CLEC6AQ6EIG7 209 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PAMR1Q6UXH9 720 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 KIF18BQ86Y91 864 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 LIX1Q8N485 282 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 TMEM251Q8N6I4 163 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ZNF781Q8N8C0 355 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SLC2A12Q8TD20 617 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 C7orf26Q96N11 449 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 TRMOQ9BU70 441 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ACPTQ9BZG2 426 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 QPCTLQ9NXS2 382 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ALKBH4Q9NXW9 302 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ADAM29Q9UKF5 820 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 RAP2CQ9Y3L5 183 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 WWP2O00308 870 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PGRMC2O15173 223 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PCDH7O60245 1069 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ATP6AP2O75787 350 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 GPR75O95800 540 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 DRD4P21917 467 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ERVK-8P63133 956 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 CPLX4Q7Z7G2 160 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 CDC20BQ86Y33 519 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SLC22A8Q8TCC7 542 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 RIT1Q92963 219 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 APIPQ96GX9 242 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 GAL3ST4Q96RP7 486 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 FAIM2Q9BWQ8 316 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 LIME1Q9H400 295 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 NEUROD4Q9HD90 331 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 DLL4Q9NR61 685 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PNPOQ9NVS9 261 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 CRIM1Q9NZV1 1036 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ERVK-19Q9WJR5 959 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 FBN3Q75N90 2809 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PS29 197 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PINLYPA6NC86 204 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 TMEM233B4DJY2 109 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 HRKO00198 91 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms