RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 ITGAMP11215 1152 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 IL7P13232 177 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 GGT5P36269 586 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PREPP48147 710 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 GSK3BP49841 420 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TNFSF10P50591 281 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 VBP1P61758 197 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 EMX2Q04743 252 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TNK1Q13470 666 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 GPR50Q13585 617 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PRPSAP1Q14558 356 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SLC9A5Q14940 896 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 DPYSL2Q16555 572 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CARTPTQ16568 116 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SHEQ5VZ18 495 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PAMR1Q6UXH9 720 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SLC22A9Q8IVM8 553 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 MIER2Q8N344 545 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PGBD5Q8N414 524 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 AMER2Q8N7J2 671 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SETD9Q8NE22 299 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 FCGR1BQ92637 280 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TMCO6Q96DC7 493 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 MAP6Q96JE9 813 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 LYSMD1Q96S90 227 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SLC52A3Q9NQ40 469 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SCN3BQ9NY72 215 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 USP22Q9UPT9 525 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 AUP1Q9Y679 476 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 GTF3C1Q12789 2109 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 HIVEP2P31629 2446 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 A0A0G2JMP0 313 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 LEUTXA8MZ59 168 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 H7C1Q1 480 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CTDSP2O14595 271 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TPST1O60507 370 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CTAG2O75638 210 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 KLHL18O94889 574 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PEX11BO96011 259 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 F10P00742 488 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 UMODP07911 640 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 RBP1P09455 135 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CBSLP0DN79 551 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 IL7RP16871 459 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ERCC2P18074 760 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 MMP11P24347 488 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 HLA-DMAP28067 261 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 HOXC12P31275 282 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CBSP35520 551 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TALDO1P37837 337 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 HTR2BP41595 481 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SPINT3P49223 89 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CDH13P55290 713 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 B2MP61769 119 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SLC35A2P78381 396 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PMP22Q01453 160 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 LIPEQ05469 1076 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CHRNB3Q05901 458 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CACNG1Q06432 222 aa6.05□□□□□ -1.44
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